コンフレックス株式会社 モデリング/分子力学・動力学計算シミュレーション『Amber』
- 最終更新日:2020-08-19 11:07:49.0
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溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数!NMR構造の精細化も可能です
『Amber』は、生体分子のために開発された、モデリング
および分子力学と動力学計算シミュレーションのパッケージです。
モデリングでは、核酸やアミノ酸のデータを用い構造を構築したり、
溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数用意
されています。
実験データを用い、NMR構造の精細化を行うこともできます。
【特長】
■溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュール多数
■NMR構造の精細化が可能
■動力学計算のトラジェクトリーを解析するツールあり
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
基本情報モデリング/分子力学・動力学計算シミュレーション『Amber』
【プログラム概要(抜粋)】
■sander: 分子動力学計算を行うメインプログラム
■pmemd: sanderの計算速度を大幅に改良したもの
■NAB: 分子構造を操作する事に特化したプログラムを書くための言語環境
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
価格帯 | お問い合わせください |
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納期 | お問い合わせください |
用途/実績例 | 【利用例(抜粋)】 ■NMRリファインメント ■QM/MM/MD ■NEB法 ■脂質二重膜 ■アンブレラ・サンプリング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 |
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