受託サービス『Visium 空間的遺伝子発現解析』 KOTAIバイオテクノロジーズ

染色画像と遺伝子発現解析マップを重ね合わせることで、細胞の特長と実際の遺伝子発現を比較

『Visium 空間的遺伝子発現解析』は、組織切片から、細胞の位置情報を
保持したまま、遺伝子発現解析を行うことができます。

6.5mmx6.5mmの区画内に載せた組織から、5000スポットの細胞を解析可能。

1スポットで平均1～10個の細胞を捕捉し、1スポットに1種類のバーコードを
付与して位置情報を保ったままmRNA解析が行えます。

【特長】
■6.5mmx6.5mmの区画内に載せた組織から、5000スポットの細胞を解析可能
■組織内の細胞の位置情報を保ったまま、RNA発現解析
■HE染色画像と、遺伝子発現マップを比較検討

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

関連リンク - https://www.kotai-bio.com/service/details/visium/

基本情報受託サービス『Visium 空間的遺伝子発現解析』

【サンプル受け入れ条件】
■包埋方法はOCTのみで、規定品を使用していること
■既定の方法で凍結し、組織切片を作製・切り出していること
・液体窒素上でイソペンタンに浸け急速凍結している
・薄切片を10μm以下で切り出せること
・切片のサイズはキャプチャーエリア(6.5mmx6.5mm)以内に収まること
■以下の枚数の薄切片作製・スライドへの貼り付けが可能であること
・TO：同組織ブロックのサンプルから7枚
・GEX：1スライド内に4枚(別々のサンプルでもよい)
■事前に、OCT包埋組織から10枚の切片を用いて RNA抽出を行い、
　RNAクオリティ(RIN値)が7以上あることを確認している
■凍結切片をHE染色・イメージングし、崩れがないことを確認している
■GEXの解析を行うサンプルは、TOによる細胞透過酵素の反応時間を検討済みである

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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