MySkin株式会社 ３つのタイプのメタゲノム解析サービス
- 最終更新日：2021-10-13 10:10:27.0
- 印刷用ページ
顔を含む皮膚の細菌叢について、お客様ご自身で採取いただいたサンプルをお送りいただいたのち、微生物のゲノムDNAを抽出し、自社で所有している次世代シーケンサー（MiSeq illmina社）により大量配列解析を行います。得られた配列から、相同性検索および系統分類解析を実施し、データベース内の配列と高い相同性を示す配列が存在する場合は、種レベルまで微生物叢の特定が可能です。1キットより抽出されたDNAから3タイプのメタゲノム解析が可能です。お客様のご要望に応じた解析をお引き受けいたします。
基本情報３つのタイプのメタゲノム解析サービス
・細菌叢16S rRNA 遺伝子解析
本解析ではV1, V2に相当する16S rRNA遺伝子の一部分をPCR 増幅し、次世代シーケンサーで解読することによって、細菌叢に含まれる細菌の種類と存在比率を測定します。シールを貼ることができる部位であれば身体のどこからでも、皮膚上の細菌を解析することができます。
・アクネ菌タイピング解析
アクネ菌は皮膚上で最も存在量の多い細菌種です。皮脂の多い場所を好んで増殖し、加齢と共にその存在比率が減少していきます。当社では、独自にアクネ菌のコアゲノムを抽出し、既存のSingle Locus Sequence Typing (SLST)法との互換性を確保したまま精度を向上させた解析を行うことで、アクネ菌の種類（株レベル）を分類することができます。
・真菌叢ITS領域解析
真菌がもつ遺伝子であるrRNA遺伝子の中には、種ごとに配列が異なる部分が存在し、内部転写領域（ITS）と呼ばれています。弊社ではこの領域をPCRで増幅し、次世代シーケンサーで解読することでサンプル中の真菌の種類と存在比率を解析することができます。
| 価格帯 | お問い合わせください |
|---|---|
| 納期 | お問い合わせください |
| 用途／実績例 | DNA抽出から解析までの全工程をお引受けします。 |
取扱企業３つのタイプのメタゲノム解析サービス
-
-
メタゲノム解析 ・細菌叢16S rRNA 遺伝子解析 ・アクネ菌タイピング解析 ・真菌叢ITS領域解析 オプション解析 ・Staphylococcus 解析 (※16S rRNA遺伝子解析に追加のみ) ・細菌DNAのコピー数解析 (※16S rRNA遺伝子解析に追加のみ) ・各種統計解析（多様性解析・多変量解析・有意差検定・群間比較など） ・クラスタリング解析
３つのタイプのメタゲノム解析サービスへのお問い合わせ
お問い合わせ内容をご記入ください。