RNA-seqデータ解析　ユーイング肉腫の解析事例

Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析を…

lowを使って1～4、Partek Genomics Suiteを使って5～6、Partek Pathwayを使って7のデータ解析を行います。 　この実験ではユーイング肉腫から得られた2 つのがん細胞株を比較します。原発性細胞株と転移性細胞株です。同じ患者から得られたがんではない線維芽細胞を “正常”として対照群にします。正常組織とがん組織の間のゲノムの変化に加えて、原発性のがんが転移性のが...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

リガンド-受容体相互作用2次元図『PoseView』

操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ！

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■...

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MOLSISニュースレター 第10号 2019.07

創薬支援ツール等の新製品情報をはじめ、技術情報などを多数掲載！

【その他の掲載内容】 ■技術情報 ・OFF-X：臨床研究における遡及的情報の重要性 ・Scilligence Inventory 製品紹介 ・解析事例：がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索 ・MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析 ・リード化合物最適化ツール SeeSAR 9.0 リリース ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽...

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【技術情報】「GENEVESTIGATOR」解析事例

「GENEVESTIGATOR」を用いた解析事例を掲載！ がん免疫療…

に登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では、マウスがん細胞の遺伝子発現データを使った がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■PD-1の遺伝子発現 ■PD-1と共発現する遺伝子 ■細胞ごとの...

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リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応しま…

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの ...

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