データベース | イプロス医薬食品技術

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

ssなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。【対応生物種：biomedical】ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌）【対応生物種：plant】シロイヌナズナ、オオムギ、イ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LB...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメン...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

デュピルマブの潜在的な新規適応症の同定

GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現…

Nebion社のPhilip Zimmermann、Jana Sponarova、Frank Staubliは、同社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、IL-4Rαに対するモノクローナル抗体で阻害剤として働くデュピルマブの発現パターンを解析しました。『GENEVESTI...

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【新製品情報】MOE 2017.11 新機能紹介

分子系のより直感的な操作が可能に！主な新機能や機能強化をご紹介！

低分子の結合のねじれ角を回転させた際のエネルギープロファイルを予測するTorsion Profileの機能が追加されます。さらに、新しいデータコンテンツとして、TCR-MHC複合体データベースが追加されます。【掲載内容】 ■エピトープマッピング ■VRディスプレイ「zSpace」のサポート ■Torsion Profile ■DNA/RNA 関連機能の強化 ■T...

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パスウェイ解析ソフトウェア『Partek Pathway』

次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストに…

ていて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。【対応する解析メニュー】 ■パスウェイエンリッチメント解析 ■パスウェイANOVA パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。（注）Partek Inc.はKEGG ...

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ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの中から検索するBioSolveIT社製のツールです。ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すこ...

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統合計算化学システムMOE：アドオンツール『MOE-QFSS』

化合物ライブラリーから高速検索可能！類似構造検索にも対応のMOEアドオ…

『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで高速な分子構造検索が可能です。高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を強力に支援します。【特長】 ...

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FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

グメントの結合の 3 つのモードを用意しています。【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 ...

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【製品紹介】遺伝子発現データベース　GENEVESTIGATOR

データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reducti…

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された大量の実験結...

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【新製品情報】MOE-QFSSバージョンアップ紹介

統合計算化学システムMOE-QFSSの新バージョンについてご紹介！

当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 ...

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