データベース | イプロス医薬食品技術

DNA解析による微生物同定専用のソフトウェア＆DNAデータベース／専用…

】・DNA塩基配列による微生物同定の作業を大幅に効率化・専門の知識が要らない自動解析機能搭載 (分子系統解析まで実施) ・微生物の同定に有効な塩基配列データのみで構成される「微生物同定データベース」を使用。国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センターと共同開発・細菌・菌類（カビ・酵母）の2種類のデータベースを用意。定期更新で新種の登録や移籍による学名変更に対応・ユーザーデータ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社テクノスルガ・ラボ

菌叢解析のデータ解析を受託「アンプリコンシーケンスデータ解析」

fastqファイルから菌叢を推定／論文掲載用のα、β多様性解析、統計解…

びQIIME2）から選択可能です。〇Metagenome@KINによる解析・細菌・アーキアの16S rDNAは、RDP（Ribosomal database project）と微生物同定データベースの2種類で解析・微生物同定データベースは、BLASTのcut-of f条件を相同率97％からご指定の値に変更可能・3検体以上の場合は、クラスター分析および主成分分析まで実施〇QI...

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腸内細菌叢や菌類叢解析受託「生体関連アンプリコンシーケンス解析」

ヒトや動物種の糞便、口腔内、皮膚といった幅広い生体由来検体を解析/DN…

MiSeqのみ） ○クオリティフィルタリング（fastaファイル取得） ○データ解析【データ解析は2種類のソフトウェアから選択可能】 ○セット1：Metagenome@KIN 　データベース（細菌・酵母）：RDP＋テクノスルガ・ラボ微生物同定データベース 　データベース（真菌）：RDP ○セット2：QIIME2 　データベース（細菌・酵母）：Greengenes datab...

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土壌など環境検体の菌叢解析「環境関連アンプリコンシーケンス解析」

土壌、活性汚泥、環境水、バイオフィルム、培養液、発酵食品など幅広い検体…

MiSeqのみ） ○クオリティフィルタリング（fastaファイル取得） ○データ解析【データ解析は2種類のソフトウェアから選択可能】 ○セット1：Metagenome@KIN 　データベース（細菌・酵母）：RDP＋テクノスルガ・ラボ微生物同定データベース 　データベース（真菌）：RDP ○セット2：QIIME2 　データベース（細菌・酵母）：Greengenes datab...

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微生物の迅速同定（DNA解析）細菌、カビ、酵母「Rapid解析」

4営業日で微生物の名前を同定！BLASTの結果のみなら細菌・酵母2営業…

します。〇医薬品や食品・飲料メーカー等で衛生管理・試験・検査を担当され、特に迅速かつ正確な同定を要求されるお客様にお勧めです。〇DNA塩基配列解析を用いたRapid解析では、国際塩基配列データベース (INSD：DDBJ/ENA/GenBank) に加え、微生物同定用DNAデータベース&系統解析システム「ENKI」による照合・系統樹作成のうえ、帰属種および近縁種を推定します。細菌のデータベ...

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微生物の迅速同定受託／結果を当日報告「MALDI微生物同定試験」

衛生管理向け迅速同定に最適／属種の同定／細菌と酵母なら正午までの検体到…

どのコストが不要となり検査部門のコストを削減。〇衛生管理目的の迅速・安価な同定に最適。〇バイオバーデン等で大量に検出された微生物株を安価に同定する場合にも有効。【報告内容】〇データベースとの照合結果から推察される候補菌種(同定結果) と信頼値(スコア) 〇候補菌種のバイオセーフティーレベル(BSL) 〇参考データ：照合結果の相同性が高かった上位10 位までの〇データベ...

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微生物特許や新種提唱での特徴付け試験を受託「細菌Premium」

遺伝子解析、形態観察、生理・生化学的性状試験、化学試験の受託／遺伝子解…

リセロールストックの場合　1本当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、連絡いたします。【納品内容】〇報告内容・国際塩基配列データベース照合結果の上位 30 位・当社微生物同定データベース 照合結果の上位 30 位・系統樹・細菌第一段階試験結果・細菌第二段階試験結果・総合考察文章（同定に至った経緯の...

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微生物特許や新種提唱時の特徴付試験を受託「酵母Premium」

酵母の遺伝子解析と形態観察による総合考察付き試験受託サービス／遺伝子解…

【受け入れ可能検体】平板培養物、液体培養物、スラント（斜面培養物）、アンプル、グリセロールストック【納品内容】・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位・当社微生物同定データベース照合結果の上位30位・系統樹・酵母形態観察結果・酵母第二段階試験 (生理・生化学的性状) ・総合考察文章 (同定に至った経緯の文...

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微生物特許や新種提唱での特徴付け試験を受託「カビPremium」

遺伝子解析と形態観察の総合考察付き受託試験／遺伝子解析単独での試験より…

【受け入れ可能検体】平板培養物、液体培養物、スラント（斜面培養物）、アンプル、グリセロールストック【納品内容】〇カビPremium ・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位・当社微生物同定データベース照合結果の上位30位・系統樹(rDNAのITS領域) ・カビ第一段階試験結果・総合考察文章(同定に至った経緯の文章説明) ...

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