「リアルタイムPCR」特定菌群の定量分析

〇次世代シーケンサー（MiSeq、Illumina社）によるアンプリコンシーケンス解析です。腸内細菌叢（腸内フローラ）解析、皮膚常在菌叢解析、口腔内細菌叢解析など様々な試料中のマイクロバイオーム解析を受託するサービスです。DNAやRNA抽出、PCR、シーケンス、解析を一括で承ります。ご依頼の際には糞便、腸管内容物、だ液等をご送付ください。納品データは学術論文にも使えます。
〇当社採取キットをご利用頂くことで検体の室温保管が可能です。
〇菌叢解析により得られる結果は特定の菌群の存在比であり絶対量ではありません。リアルタイムPCRを併用することで、DNA量という形で微生物の絶対量も定量できます。
〇サービスのポイント
・優れたコストパフォーマンス
・細菌/アーキアの微生物叢を一括解析
・細菌の約430 bp、アーキアの約385 bp（ペアエンド）長の配列を解析
・ ITS領域により菌類叢を解析
・約10,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出
・ RNAの解析にも対応
・取得済み配列データから解析のみのご依頼にも対応
・α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析などのオプションもあり （詳細を見る）

〇検体中の細菌、アーキア、菌類の菌叢（マイクロバイオーム）解析を受託するサービス。
〇土壌、水、バイオフィルム、コンポストなど発酵槽内容物、活性汚泥、浄化槽内容物、発酵食品、プロバイオティクス、変敗食品等、様々な試料に対応。
〇次世代シーケンサー（MiSeq, Illumina社）を用いたアンプリコンシーケンス解析。
〇DNAやRNA抽出作業から承りますので、ご依頼の際には検体そのものをを当社までご送付可能。
〇納品データはR&Dから学術論文まで幅広く利用可能。
〇サービスのポイント
・優れたコストパフォーマンス、20,000円～/検体
・細菌/アーキアの微生物叢を一括解析
・細菌の約430 bp、アーキアの約385 bp（ペアエンド）長の配列を解析
・ ITS領域により菌類叢を解析
・約10,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出
・ RNAの解析にも対応
・取得済み配列データから解析のみのご依頼にも対応

解析方法などお気軽にお問合せください。 （詳細を見る）

【特 長】
〇当社所有のプライマーセットを用いて目的対象とする微生物の鋳型DNAの量（コピー数）を定量する受託分析サービス
〇環境関連や食品関連の微生物を検出可能なオリジナルプライマーを含む多くのプライマーを保有
〇微量な検体からでも正確な定量が可能

【概 要】
検体中に含まれる特定分類群の遺伝子を定量します。リアルタイムPCR 装置により指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムでモニタリングします。全細菌および全アーキアのDNAコピー数と比較することで、検体中の標的菌群の割合を推定することも可能です。

【受け入れ可能な検体例】
発酵食品等の食品試料、活性汚泥試料、浄化槽試料、土壌、火山灰等の土壌系試料、堆肥、コンポスト、培養液等の発酵試料、海水、湖沼水などの水系試料、発酵槽の内容物、PCR 増幅が確認されたDNA 抽出物等

【検出対象菌群】
多くの菌群を検出・定量可能です。関連リンクをご参照ください。

試験方法や検出できる菌群について、お気軽にお問い合わせください。また、関連リンクからも詳細をご確認いただけます。 （詳細を見る）

【概要】
〇検体中に含まれる細菌、アーキア、菌類のDNA量を定量する受託分析サービスです。検体間の微生物量を比較する際にご利用頂けます。
〇検体中に含まれる特定分類群の遺伝子について、リアルタイムPCRにより指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムでモニタリングします。
〇微生物の種類によってはコピー数を菌数に変換することも可能です。

【特 長】
〇微生物（細菌、カビ、酵母、アーキア）の定量が可能
〇当社所有のプライマーセットを用いて目的対象とする微生物の鋳型DNAの絶対量（コピー数）を推定
〇腸内細菌、口腔内細菌、皮膚常在菌、環境試料や食品試料中微生物等の連のオリジナルプライマーを含む多くのプライマーを保有
〇微量な検体からでも正確な推定が可能

【受け入れ可能な検体例】
〇マウス、ラット、ブタ、ウシ、ウマ、ペットなどの動物糞便、腸管内容物
〇唾液、プラーク、皮膚拭取物、膣内拭取物

【検出対象菌群】
関連リンクをご参照ください。

その他、試験方法や受け入れ可能検体について、お気軽にお問い合わせください。



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