統合計算化学システム『MOE』

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。

【特長】
■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応
■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応
■目的に応じて使い分けできる使用モード
■低分子・フラグメント・標的タンパク質データベース
■新機能開発やカスタマイズ
■サードパーティ製品との連携
■Windows/Mac/Linuxに対応
■計算化学者、実験研究者が広く利用
■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応

【搭載アプリケーション】
■分子モデリング
■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算
■ドッキングシミュレーション
■構造活性相関・ケモインフォマティクス
■タンパク質・抗体モデリング
■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン
■核酸モデリング
■ファーマコフォア解析
■フラグメント構造に基づく分子設計 （詳細を見る）

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。
拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。

分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。

以下のような分子構築に対応しています。
■低分子
■ペプチド・タンパク質
■アミノ酸配列
■変異体構築
■DNA
■糖鎖
■合成ポリマー
■溶媒分子やカウンターイオンの配置
■バルクモデル（液滴、周期境界条件）
■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応

以下のような分子シミュレーションが可能です。
■構造最適化計算
■配座解析
■分子動力学計算
■量子化学計算
■スペクトル予測(NMR, VCD)
■分子アラインメント
■3D-RISM法による溶媒解析
■ドッキングシミュレーション （詳細を見る）

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。

以下のような解析が可能です。
■ドッキングシミュレーション
■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正）
■水素原子付加状態の決定
■ポケット探索
■フラグメント結合位置検索
■結合部位中での分子設計
■リガンド-受容体との相互作用解析
■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析
■母核置換とのフラグメントベースの分子設計
■3D-RISM法による溶媒解析
■タンパク質表面解析
■SBDDのためのプロジェクトデータ構築 （詳細を見る）

株式会社技術情報協会から2018年1月31日に「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」が発刊されました。

本書には、コンピュータの処理能力の速さを活かしつつ、計算コスト増大の課題をいかに克服するか？という課題についてin silico創薬を成功に導く計算科学やスパコン、データベース構築の重要技術が満載されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。

第4章「in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例」の第2節で「MOE」を用いた創薬研究の効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。

本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！
「PDFダウンロード」からはMOEのカタログをダウンロードできます。 （詳細を見る）

KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。

ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。
プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。
MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング（機械学習）などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。
 （詳細を見る）

当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。

「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ
横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。

新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと
MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。

さらに、QFSSのMOE/webアプリケーションを提供。それによって目的や
計算資源に応じたQFSSの実行環境を構築できます。

【掲載内容】
■QFSS概要
■QFSSによる検索
■バージョンアップ内容
■QFSSを用いた応用事例
■QFSSの入手方法

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。
直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、
計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。

国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、
タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、
ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。

現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍
『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』
の抜刷資料を進呈中。

「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。

※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。 （詳細を見る）

『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に
構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。

リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで
高速な分子構造検索が可能です。

高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を
強力に支援します。

【特長】
■部分構造の超高速検索
■類似構造検索に対応
■分子記述子フィルター
■化合物ライブラリーの追加
■連続検索に対応

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

『MOE』は、柔軟な核酸モデリングが可能です。
二本鎖および一本鎖核酸を容易にモデリングでき、修飾核酸にも対応。
塩基配列のセンス、アンチセンス表示や塩基配列のアライメント、
核酸構造の重ね合わせも可能です。

また、構築した核酸の物性推算や、ドッキング計算による核酸-タンパク
質複合体の構造予測ができます。

核酸の配列・立体構造・相互作用・物性を相互に関連付けて
解析することで、核酸創薬の現場を強力に支援します。

【特長】
■核酸の構築、伸長、修正のための専用パネルを搭載
■核酸用パラメーターの改良
■一本鎖および二本鎖の構築、伸長、編集
■アンチセンス対応
■核酸のアライメント・重ね合わせ

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

近年、抗体医薬品開発を効率化するためにインシリコによる合理的な設計が益々重要となっています。

統合計算化学システム MOEは、低分子、ペプチド、抗体、核酸などの広範なスケールの分子の設計に活用でき、創薬モダリティー開発に対応した分子モデリングソフトウェアです。ホモロジーモデリング、タンパク質デザイン、バーチャルファージディスプレイ、エピトープマッピング、分子表面解析、物性推算、化学的修飾候補部位の検出など抗体設計に活用できるアプリケーションがMOEには統合されています。

Fv、Fab、F(ab’)、rIgGなどの各領域、抗体の全長構造、二重特異性抗体(bispecific抗体)、一本鎖抗体(scFv)、ADC(Antibody-drug conjugate)、VHH/VLL抗体など様々な抗体構造のモデリングと設計をMOEはカバーします。構築した抗体と抗原の分子間相互作用解析、Developability（開発可能性）の評価などが可能です。

MOEは、計算化学者から実験研究者まで幅広く利用されています。
無料アプリケーション紹介セミナーも開催中（お問い合わせください） （詳細を見る）

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の
入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。

相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、
それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。

予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。

【機能】
■抗体データベース
■領域別のアノテーション
■抗体のための相同配列検索
■抗体モデリング
■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体
■表面パッチ解析
■タンパク質ータンパク質ドッキング
■エピトープ・マッピング
■タンパク質の物性推算
■ループ/リンカーモデリング
■MOE/webアプリケーション
■モデリングの自動化

カタログを刷新しました。
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
 （詳細を見る）

《情報計算化学生物学会 2020 年大会で開催したモルシス企業セミナーの動画のリンクと資料をご提供します。》

創薬モダリティの多様化に伴い、創薬研究支援ソフトウェアにはモダリティに対応した機能が求められています。弊社取り扱い製品の中から「統合計算化学システム MOE」、「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。

・MOE
低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム

・Scilligence
多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム

・OFF-X
規制機関、学術論文、学術会議、企業等の情報源から収集された前臨床試験の毒性情報と臨床試験および市販後の安全性情報を統合し、解析機能と組み合わせて情報提供する医薬品の安全性情報ポータル

※詳しくはPDFダウンロード、またはお問い合わせください。 （詳細を見る）