肌の細菌叢や菌類叢の採取キットと菌叢解析受託サービス「皮膚微生物叢解析」2021.3.3

〇次世代シーケンサー（MiSeq、Illumina社）によるアンプリコンシーケンス解析です。腸内細菌叢（腸内フローラ）解析、皮膚常在菌叢解析、口腔内細菌叢解析など様々な試料中のマイクロバイオーム解析を受託するサービスです。DNAやRNA抽出、PCR、シーケンス、解析を一括で承ります。ご依頼の際には糞便、腸管内容物、だ液等をご送付ください。納品データは学術論文にも使えます。
〇当社採取キットをご利用頂くことで検体の室温保管が可能です。
〇菌叢解析により得られる結果は特定の菌群の存在比であり絶対量ではありません。リアルタイムPCRを併用することで、DNA量という形で微生物の絶対量も定量できます。
〇サービスのポイント
・優れたコストパフォーマンス
・細菌/アーキアの微生物叢を一括解析
・細菌の約430 bp、アーキアの約385 bp（ペアエンド）長の配列を解析
・ ITS領域により菌類叢を解析
・約10,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出
・ RNAの解析にも対応
・取得済み配列データから解析のみのご依頼にも対応
・α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析などのオプションもあり （詳細を見る）

〇皮膚疾患、化粧品開発、アンチエイジングなどの分野で肌の細菌叢が注目を集めています。本キットは、容易に皮膚常在菌の採取と保存が可能な皮膚菌叢解析用採取キットです。腸内細菌叢解析で培った検体保存の技術を応用し、常温でも菌叢を維持できるようにしました。

〇アンプリコンシーケンス解析による菌叢解析に使えます。

〇本キットでは、生理食塩水に浸された綿棒を皮膚上で回転させながら擦ることで皮膚常在菌を採取し、拭き取った綿棒を保存液に浸すことで、菌叢の変化を抑えます。

〇粘着テープとは異なり、角質へのダメージも少なく採取可能です。

〇検体を採取したキットを当社宛にご送付いただければ、菌叢解析（アンプリコンシーケンス解析）の受託解析も利用できます。

使用方法などについて、お気軽にお問い合わせください。 （詳細を見る）

【概要】
解析方法については、2種類の解析ソフトウェア（Metagenome@KINおよびQIIME2）から選択可能です。
〇Metagenome@KINによる解析
・細菌・アーキアの16S rDNAは、RDP（Ribosomal database project）と微生物同定データベースの2種類で解析
・微生物同定データベースは、BLASTのcut-of f条件を相同率97％からご指定の値に変更可能
・3検体以上の場合は、クラスター分析および主成分分析まで実施

〇QIIME2による解析
・Amplicon Sequence Variant (ASV) 法により、相同率の高い近縁種同士の識別が可能
・学術論文で求められる二次解析 (多様性解析や統計解析の機能) が充実

【受入可能なデータ】
次世代シーケンサーによるシーケンスデータ（fastqファイル）
腸内細菌叢、皮膚細菌叢、口腔内細菌叢、土壌、活性汚泥など、様々な検体から得られたシーケンスデータを解析できます。

その他統計分析ソフトRによるデータ解析やPICRUSt2による予測メタゲノム解析も受託します。 （詳細を見る）