株式会社ダナフォーム
最終更新日:2023-07-09 19:30:07.0
キアゲン社コラボのRNA-seq
基本情報キアゲン社コラボのRNA-seq
キアゲン社と弊社ダナフォームのコラボプラン。1サンプル4万円~7万円のラインナップです。
価格を抑えた 1サンプル4万円~のラインナップを実現しました。ライブラリ作製キットにキアゲン社QIAseqシリーズ、シーケンサーはコスパ良しのMGI DNBseqを使用。
納品データは2セット、(1)弊社通常のデータセットに加え、(2)キアゲン社ポータルサイトによる解析データも搭載。
キアゲン社ポータルサイトでは、ウェブ上で納品データをご自身の手によりインタラクティブな使い方が可能。ボルケーノプロットやヒートマップなどを拡大縮小やフォーカス表示など、自在にアレンジ表示できるのが何より魅力です。
使い方の一例:
データ量少なめ3Gb(4万円、ご注文は6サンプルから)、しっかりメジャーに発現している遺伝子を絞り込み、キアゲンポータルサイトを使ってパスウェイやPCAによる分析と確認。
「3’トランスクリプトーム」は、主に発現量が分かればOKのとき。
「全長トランスクリプトーム」は、発現量とスプライシングバリアントもみたいときに。
レプリケイトN数の再現性なら「全長トランスクリプトーム」がおすすめです。
解析付きNGS受託サービス、RNAseq 6Gbキャンペーン
当社のNGS受託サービス各種は、初めてでも安心のデータ解析付きです。
発現解析の「RNA-seq」や「CAGE」はTotal RNAを送るだけ、
USBやHDDにて解析データをお届けします。
目的に合わせたrRNA除去やde novoアセンブリもございます。
「CAGE」は「RNA-seq」よりも定量性が高い遺伝子発現解析が可能。
「NET-CAGE」ではエンハンサーRNA解析の新技術です。
他にも「ATAC-seq」、「ChIP-seq」、「WES」、「WGS」、など。
MGI DNBSEQシーケンサーも2021年秋から本格始動。
2022年秋に増設、イルミナNextSeq2000を導入しました。
【特長】
■RNA-seqの提出RNAは total RNA 1ug
■RNA-seq、ヒトやマウスのとき10ngスタートも可能
■まさに1細胞を解析、Ultra Low なRNA-seqも人気プラン
■RNA抽出オプション
■目的に合わせた不要RNA除去やde novoアセンブリもご用意
※解析条件のアレンジはお気軽にお問い合わせ下さい。 (詳細を見る)
受託解析『RNA-seq』※初心者向け小冊子を進呈
『RNA-seq』は、次世代シークエンシング解析の一つで、
トランスクリプトームと呼ばれる遺伝子発現を網羅的に検出する手法です。
様々な生物種に対応し、遺伝子および転写産物の発現レベルと
スプライシングパターンの解析を行うことができます。
モデル生物であれば最短3~4週間の短納期で結果の納品が可能。
納品時にはデータ確認ガイド(手引き冊子)が付属するため、初心者でも安心です。
【特長】
■価格を抑えたプランや、DNBseqシーケンス受託サービスもご用意
■新規転写産物の同定
■Total RNA 1μgまたは10ngスタートが可能
■モデル生物を始めとした様々な生物種で実績あり
(ヒト、マウス、植物、魚、カエル、酵母、バクテリアなど)
※原理やメリットをわかりやすく紹介した小冊子を進呈中。
「PDFダウンロード」よりスグにご覧いただけます。 (詳細を見る)
受託解析『RNA-seq』※基礎から分かる小冊子進呈!
『RNA-seq』は、NGSシークエンシング受託解析の一つで、
遺伝子の発現解析(トランスクリプトーム)を網羅的に行う手法です。
様々な生物種に対応、遺伝子および転写産物の発現レベルと
スプライシングパターンの解析を行うことができます。
■トランスクリプトームの網羅的解析
■遺伝子および転写産物の発現レベルとスプライシングパターンの解析
■新規転写産物の同定
■モデル生物を始めとした様々な生物種で実績があります。
(例. ヒト、マウス、植物、魚、カエル、酵母、バクテリアなど)
当社では独自技術の受託解析サービス『CAGE-seq』も提供しております。
■PCRフリーのため定量性に優れ、検出感度はRNA-seq解析に比べ約7倍
■RNAの転写開始点検出に強みがあります
■モデル生物を始め、ゲノム情報の有る真核生物に
■がんと疾患で転写開始点の使い分けが分かり、バイオマーカー候補探索に活用した使用例も
※原理やメリットをわかりやすく紹介した小冊子を進呈中。
RNA-seqとCAGE-seqについて、両者の違い、技術や価格をFAQ形式で分かりやすく紹介しています。 (詳細を見る)
キアゲン社コラボのRNA-seq
お手頃4万円から、複数の解析プランをラインナップ。
データ解析込み、USB納品とウェブポータル上の操作も可能、なんとも驚きのデータ山盛りプランです。
リード数やストランド情報までしっかりプランまで。ライブラリ作製キット3種を使い分け、幅広い生物種に対応可能です。ヒトやマウスの哺乳類から、植物や魚、酵母、乳酸菌などバクテリアまで。
よくあるお悩みポイント:
・リード数をどれくらい取ろう
・全長か3'側か
・ストランド情報が必要なのかな
解析条件やプランを迷うときには、お気軽にご相談ください。 (詳細を見る)
取扱会社 キアゲン社コラボのRNA-seq
キアゲン社コラボのRNA-seqへのお問い合わせ
お問い合わせ内容をご記入ください。