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最終更新日:2024-09-20 16:21:16.0

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FPGA や GPU フリーの超高速変異解析(LightSpeed Module)

専門知識不要の簡単 NGS 生データ2次解析ツール

専門知識不要の簡単 NGS 生データ2次解析ツール 製品画像

QIAGEN CLC Genomics Workbench (CLC GWB) は、GUI (グラフィカルユーザーインターフェイス) 操作のみでNGS データ2次解析を可能にします。フリーツールを用いた解析の場合、複雑な解析ワークフローの構築にバイオインフォマティクスの専門知識を必要とすることが多く、また多様な解析目的に対応していません。CLC GWB は、多様な目的での NGS データ解析を可能にするツールで、コマンドラインの使用やコーディングも必要ありません。CLC GWB を用いれば、RNA-seq、変異解析、微生物関連解析といった多様な解析を同様の GUI 操作で行えるため新し解析法の習得が容易です。ユーザーは自由に解析に用いるリファレンス配列を変更でき、ワークフローを構成する各ツールの互換性に悩まされることもありません。これらの特徴は、CLC GWB が医学生物学研究のみならず、バイオ医薬品の品質管理にも 使用される理由になります。

【特徴】
■GUI 操作での多様な NGS 2次解析
■多様な目的での NGS 2次解析
■有償・無償のプラグイン高拡張性
■ウエット研究者使用可能
 (詳細を見る

QIAGEN CLC Genomics Workbench

QIAGEN CLC Genomics Workbench 製品画像

QIAGEN CLC Genomics Workbench (CLC GWB) は、GUI (グラフィカルユーザーインターフェイス) 操作のみでNGS データ2次解析を可能にします。フリーツールを用いた解析の場合、複雑な解析ワークフローの構築にバイオインフォマティクスの専門知識を必要とすることが多く、また多様な解析目的に対応していません。CLC GWB は、多様な目的での NGS データ解析を可能にするツールで、コマンドラインの使用やコーディングも必要ありません。CLC GWB を用いれば、RNA-seq、変異解析、微生物関連解析といった多様な解析を同様の GUI 操作で行えるため新し解析法の習得が容易です。ユーザーは自由に解析に用いるリファレンス配列を変更でき、ワークフローを構成する各ツールの互換性に悩まされることもありません。これらの特徴は、CLC GWB が医学生物学研究のみならず、バイオ医薬品の品質管理にも 使用される理由になります。

【特徴】
■GUI 操作での多様な NGS 2次解析
■多様な目的での NGS 2次解析
■有償・無償のプラグイン高拡張性
■ウエット研究者使用可能
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全ゲノム・全エキソームシーケンス変異解析・評価・レポーティング

全ゲノム・全エキソームシーケンス変異解析・評価・レポーティング 製品画像

臨床および集団ゲノミクスでは、全ゲノムシーケンス(WGS)および全エキソームシークエンス(WES)が主流になりつつあります。しかしながら、大量のデータ解析は、インフォマティクスの専門知識、解析速度、コスト面で大きな負担であり、大量に検出される変異の解釈はさらなる重荷になっています。
QIAGEN の高速 NGS データ2次解析ツール、QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium の LightSpped Module は、FPGA や GPU のような高価な専用ハードウェアを必要とせず、コスト面でも大きな利点があります。変異評価の世界的データベース、HGMD Professional(生殖細胞変異)、COSMIC(体細胞変異)、HSMD(体細胞変異)や、生殖細胞・体細胞変異の解釈を透明性を保って実施する QCI Interpret は、大量の変異評価の標準化、低コスト化、高速化をサポートします。全ゲノムシーケンス由来の大量の変異評価にお困りの方、是非、お問合せ下さい。

【特徴】
■高速 NGS 2次解析
■体細胞・生殖細胞変異の評価の透明化・高速化・標準化
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取扱会社 FPGA や GPU フリーの超高速変異解析(LightSpeed Module)

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【主要な製品分野】 ■デジタル PCR (dPCR) ■新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) 検査 ■核酸の安定化・保存 ■核酸精製関連試薬(対象サンプル:血液、哺乳類細胞・組織、FFPE 検体、植物、微生物、ウイルスなど) ■自動核酸精製装置(QIAcube Connect、EZ2 Connect、QIAcube HT、QIAsymphony) ■マルチキャピラリー電気泳動装置(QIAxcel Connect) ■NGS データの2次解析(QIAGEN CLC Genomics Workbench、Genomics Server) ■遺伝子発現プロファイル解釈(QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis、QIAGEN OmicSoft) ■ヒト生殖細胞および体細胞変異の解釈(HGMD professional、COSMIC、QIAGEN Clinical insight Interpret) ■生物医学知識ベース(Biomedical knowledge Base)

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