『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。
タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データ共有を支援します。
公共データやin-houseデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースの
インターフェースから容易にアクセスすることができます。
【特長】
■高速なテキスト検索
■タンパク質/抗体アミノ酸配列検索
■タンパク質立体構造全体の重ね合わせ
■リガンド結合部位の2D/3D表示
■PDBデータの自動更新
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
基本情報タンパク質立体構造情報データベースシステム『PSILO』
【機能】
■検索
・高速なテキスト検索
・タンパク質/抗体アミノ酸配列検索
・類似ポケット構造検索
・3D相互作用検索
・化合物部分構造・類似構造検索
■タンパク質立体構造の重ね合わせ
・タンパク質立体構造全体の重ね合わせ
・ポケット類似性による重ね合わせ
・リガンド構造による重ね合わせ
・重ね合わせ構造における相互作用の比較
・重ね合わせ構造のMOEへの読み込み
■データ表示
・リガンド結合部位の2D/3D表示
・電子密度図の描画
・タンパク質立体構造のヘルスチェック
・タンパク質機能部位のアノテーション
・アミノ酸配列のアノテーション
■データ更新とバージョンコントロール
・PDBデータの自動更新
・in-houseデータの簡単な登録
・コメントフォーラム
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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用途/実績例 | ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 |
取扱企業タンパク質立体構造情報データベースシステム『PSILO』
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