株式会社ファスマック 微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)
- 最終更新日：2021-11-12 14:35:02.0
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迅速かつ高精度！7つの遺伝子領域を同時に同定し菌のタイピングを行う方法をご紹介※解析事例集進呈中
ファスマックでは、『微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)』
を承っております。
「MLST解析」とは、複数の遺伝子領域(通常7領域以上)の変異を
パターン化して、菌のタイピングを行う方法で、16srRNA遺伝子解析では
判別できなかった詳細な株の情報が得られます。
NGSを利用した「MLST解析」はショットガンゲノムシークエンスにより
得られた配列データを近縁種のゲノムにマッピングすることによって
7つの遺伝子領域を同時に同定し菌のタイピングを行う方法であり、
従来の方法に比べて迅速かつ高精度に行うことができると考えられます。
ファスマック次世代シーケンス解析サービスに微生物タイピング解析を
ラインアップしました。 ご用命の際はお気軽にお問い合わせください。
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
基本情報微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)
【解析のワークフロー】
■Sample Sequence Reads
■クオリティフィルタリング
■K-mer分布を用いた最近縁種の推定
■近縁種へのマッピング
■MLST解析のための遺伝子領域の同定
■MLSTデータベースを用いたMLST解析
■K-mer 系統樹の作成 SNP系統樹 ※オプション解析
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カタログ微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)
取扱企業微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)
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○食品の遺伝子検査 ○食品検査試薬の販売 ○遺伝子工学用試薬の製造・販売 ○DNA解析サービス 〇各種受託サービス（DNA合成、遺伝子合成他） 〇ゲノム編集ツール 〇次世代シーケンス解析 〇プライマー/遺伝子合成 〇各種検査サービス 〇試薬キット販売 〇監査・コンサルティング
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