株式会社テクノスルガ・ラボ 腸内細菌、カビ、酵母の菌叢解析受託「アンプリコンシーケンス解析」
- 最終更新日：2024-12-20 17:51:26.0
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● 腸内細菌叢、皮膚菌叢、口腔内細菌叢など様々な試料中のマイクロバイオーム解析を受託
● 1検体から受入可能
● 次世代シーケンサー（MiSeq、Illumina社）によるアンプリコンシーケンス解析
● DNA抽出、PCR、シーケンス、解析を当社内で一括対応
● α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析などのオプションもあり
● 納品データは学術論文にも利用可能
● 当社糞便採取キットを利用すれば検体の室温保管が可能
アンプリコンシーケンス解析は、多様な生物種が混在する検体中の生物群集を解析する優れた方法。
検体から抽出した混合DNAに、検体を識別するためのバーコード配列を付加したプライマーでPCR増幅～シーケンス解析を行い、一度に数万～数十万の配列を得ます。
一度の解析で大量の塩基配列を得られ、網羅的に細菌、カビ、酵母を検出可能。
【詳細は関連リンクをご確認ください】
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基本情報腸内細菌、カビ、酵母の菌叢解析受託「アンプリコンシーケンス解析」
■受入可能な検体
A区分：糞便、腸管内容物、 ルーメン液
B区分：唾液、プラーク、皮膚拭取物、その他A区分以外
■仕様
● セット1：
・解析ソフトウエア：Metagenome@KIN
・データベース：RDP、テクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」
● セット2：
・解析ソフトウエア：QIIME2
・データベース：Greengenes、SILVA、UNITE
■納品内容
● セット1
・NGSシーケンス生データ（fastqファイル）
・クオリティーフィルタリング、キメラチェック後のシーケンスデータ（fastaファイル）
・データ解析結果（csv、htmlファイル）
● セット2
・NGSシーケンス生データ（fastqファイル）
・クオリティーフィルタリング、キメラチェック後のQIIME2出力データファイル（qzvファイル）→代表配列とリード数の一覧、相同性検索結果（表、バーチャート）
■検体の送付方法
● 冷凍または冷蔵で送付してください
● 糞便の場合は冷凍推奨
● 当社採取キットを使用すれば、菌叢変化を防ぎながら冷蔵輸送が可能
| 価格帯 | 1万円 ~ 10万円 |
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| 納期 |
お問い合わせください
※選択コースによる |
| 用途／実績例 | ・腸内細菌叢（腸内フローラ）解析による機能性食品の評価。 ・食品の機能性による乳酸菌やビフィズス菌の存在比の変化の確認。 ・疾患と腸内細菌叢（腸内フローラ）の関係についての学術研究。 ・口腔内細菌叢（口腔内フローラ）の解析。 ・製品開発のための皮膚常在菌叢（皮膚フローラ）の解析。 ・アンチエイジング研究 |
取扱企業腸内細菌、カビ、酵母の菌叢解析受託「アンプリコンシーケンス解析」
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● 微生物同定試験（細菌・カビ・酵母迅速同定、株識別、微生物特許寄託支援） ● 微生物分離 ● 微生物群集構造解析（土壌等環境検体中の細菌叢・菌類叢解析） ● 腸内環境分析（採便キット、腸内細菌叢解析、有機酸および短鎖脂肪酸・胆汁酸・腐敗産物・pH・水分・IgA分析） ● 微生物分類研究（形態観察、生理・生化学性状試験、分子系統解析、ANI、全ゲノムシーケンス） ● 微生物試験・分析のためのテクニカルトレーニング ● 微生物株の保管・管理
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