細胞集団の不均一性の解析や細胞系譜を推測する研究などに使用！解析事例についてご紹介 「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載しているため、 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する 遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に 行うことができます。 当資料では、2020年の10月に追加された、Single Cell RNA-seqキュレーション データを使用した解析事例について紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■特定の遺伝子が発現する細胞種の解析 ■COVID-19 患者と健常者の発現遺伝子比較 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

Single Cell RNA-seqのデータ解析を行う為の豊富な機能を搭載 『Partek Flow（以下Flow）』は次世代シーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 リード配列からバーコードやUMIのトリミング、参照ゲノム配列への アラインメント、UMIのデデュプリケーション、バーコードの絞り込みなど、 Single Cell RNA-seqの前処理に必要な機能を搭載しています。 当資料ではFlowを用いたSingle Cell RNA-seqデータ解析について ご紹介しています。 【掲載内容】 ■Single Cell RNA-seqとは ■バーコードやUMIの除去 ■UMIデデュプリケーション ■バーコードの絞り込み ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

選択した2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を確認可能 『2-Gene Plot』は、同一プラットフォーム内で横断的に遺伝子発現を解析できる 「GENEVESTIGATOR」の解析ツールの一つであるSimilarity Search Toolsに 新たに追加された解析ツールです。 選択した2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を 確認できます。 各サンプルはアノテーションにより色付けできるので、サンプルを 実験群ごとにクラスタリングすることで生物学的解釈が可能になります。 【特長】 ■Similarity Search Toolsに新たに追加された解析ツール ■2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を確認可能 ■サンプルを実験群ごとにクラスタリングすることで生物学的解釈が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

結果の確認と管理が容易！解析を行った期間を指定してまとめて結果を出力させることが可能 『FluGAS v2』は、高速シーケンサによるインフルエンザウイルスゲノム シーケンスデータから簡単な操作でサブタイプ(亜型)の判定と分節ごとの 塩基配列を決定するWindows 用のソフトウェアです。 高速シーケンサから出力される膨大なA 型およびB型インフルエンザの 全ゲノム配列シーケンスデータを自動的にアセンブルし、亜型の同定まで 行うことができます。 【特長】 ■高速シーケンスデータからインフルエンザウイルスのHA,NA亜型を自動判定 ■8つの分節の塩基配列のアセンブルを自動化 ■A型・B型両方に対応 ■トリ・ブタ・ウマ・ヒトなどすべての動物由来インフルエンザに対応 ■イルミナ社MiSeqデータ/オックスフォード・ナノポア社 ロングリードに対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせください。