分子基本パラメータ計算『Elemental Analysis』

Marvinライセンスで利用可能！分子の元素構成に関する値を計算・表示…

パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass：molecular mass ■Exact mass：molecular mass calculated from the most frequ...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

分子記述子計算『Structural Calculations』

パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用…

パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin：...

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配列SAR解析ツール『SAR>vision|Biologics』

配列解析に最適化されたスプレッドシートを提供！バイオポリマーを取り扱う…

『SARvision Biologics』は、既存のバイオロジックスソフトウエアの 隙間を埋めるデスクトップアプリケーションです。 バイオポリマーのデータを読み込み整理する為の基盤ツールと配列と活性の 関連を見出す様々なツールを提供。 配列解析に最適化されたスプレッドシートが提供され、非天然アミノ酸や 化学的に修飾された残基を含む、核酸、タンパク、ペプチドといった バイオポリマ...

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立体異性体、互変異性など、各種異性体構造の生成『Isomers』

互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成！ヴァーチャルスクリーニングへの…

パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなど...

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hERG阻害予測ツール『hERG Predictor』

信頼性の高いhERG阻害予測ツールで、心毒性リスクを創薬の早期に排除し…

創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデ...

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pKa予測・分子種予測・等電点予測『Protonation』

イオン化され得るグループのpKaを計算！蛋白などに対しても利用できます

当社は、pKa（酸塩基解離定数）等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa：高精度のpKa計算プログラム ■Microspec...

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LogP予測,LogD予測『Partitioning』

logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づ…

『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■...

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バイオモダリティー登録システム『PatRegi|Bio』

多様なバイオモダリティー情報の登録・管理をHELMネイティブのソリュー…

『PatRegi|Bio』は、特殊ペプチド、核酸、抗体、ADC、PDC、ナノ粒子コンジュゲートなど非天然または化学的に修飾された残基や化学的装飾を含む多様な生物学的モダリティーをサポートする、バイオ分子の登録・管理のアプリケーションです。 HELMネイティブのプラットフォームをベースに、モノマーの一元管理を行うことで長期にわたる相互運用性を確保し、組織内外とのデータ交換もスムーズに行えます。 ...

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水溶解度予測『Solubility』高精度で予測！

高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です！

溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳し...

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高精度物性予想『Calculator Plugins』

薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価！プロパティー…

『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。 実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。 当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグルー...

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1Hおよび13C NMRスペクトル予測『NMR』

有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します！

NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に 　重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか...

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最適化構造提案『AMEDEO』でAI創薬を手軽に！

適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけ！候補を提案し…

『AMEDEO』は、データサイエンス（AIと機械学習）で利用可能な高度なツールを専門家以外が簡単に利用し、リード最適化サイクルを高速化するためのアイデアジェネレーターとして機能します。 データについて学習し、予測的なモデルを構築および選択。 次に作成すべき化合物を明確に提案します。 最適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけで、 バイオ医薬または低分子医薬の候補を提...

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バイオアプリ用API『Biomolecule Toolkit』

HELMでバイオ分子の完全なハンドリングを実現！明確な表現を可能にしま…

『Biomolecule Toolkit』は、ADCやペプチドといった複雑なバイオ分子の取扱いにおいて、化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しするHELMベースのウエブサービスベースのツールです。 的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能。 既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張したり、バイオ分子登録システムの基盤としてご利用になれ、お客様独自のワ...

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