遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

ーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

■アノテーション ・転写開始点から見たプロモーター領域の上限下限および遺伝子データ 　ベースを選択するだけで、　検出したピークに対して遺伝子との位置 　関係のアノテーションを付加 ・ヒトやマウスなど代表的な生物種のRefSeqやEnsemblといった遺伝子 　データベースを自動的にダウンロード ■TSSプロット ・TSSを中心にしたプロモーター領域にいくつのリードがアラインメント ...

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FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの...

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【技術情報】「GENEVESTIGATOR」解析事例

「GENEVESTIGATOR」を用いた解析事例を掲載！ がん免疫療…

ースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では、マウスがん細胞の遺伝子発現データを使った がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■PD-1の遺伝子発現 ■PD-1と共発現する遺伝子 ■細胞...

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