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化学情報を効率よくハンドリング!理想的な化学情報システムを構築するため…
Daylight社のソフトウェア群は、in-silico創薬および化学情報管理システムを構築するための開発用ツールです。 化合物・化学反応情報のデータベース登録・検索や、化合物に対する様々な操作を効率よく行えるよう設計されています。システムの規模に係わらず、プロジェクトや創薬戦略に応じた理想的な化学情報管理システムが構築できます。 ■データ処理ツール 独自のデータ形式で化学情報を高速...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【新製品情報】Similarity Scanner機能の追加
構造を高速に重ね合わせ!SeeSAR 12で更新された機能を中心にご紹…
独BioSolveIT社はメディシナルケミストのためのStructure-Based Drug Design統合ツール『SeeSAR』を提供しています。SeeSAR 12では、 Ligand-Based Drug Design機能として、Similarity Scannerが追加されました。 Similarity Scannerは、標的タンパク質情報を必要とせず、化合物の 化学的特長と...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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固体エネルギーバンド構造の詳細を計算するための事例について掲載!
当資料では、III-V族化合物半導体で電子・光学デバイスのバンド構造 エンジニアリングに必要となる、固体エネルギーバンド構造の詳細を 計算するため、Hartree-Fock-DFTハイブリッド汎関数であるHSE06を用いた 事例について報告します。 InAsのエネルギーバンド、特にその微細構造を例として、精度の高い 第一原理電子状態計算を用いることで、実験に匹敵する精度と信頼性を持つ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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各ソフトウェアのアップデートと、Drugathon2022の開催報告を…
独BioSolveIT社はSBDD統合ツールSeeSARとケミカルスペース高速探索ツール infiniSeeを提供しています。SeeSAR 12.1では、FastGrow機能が搭載され、 フラグメントデータベースの拡充がなされました。 また、これらのソフトウェアを活用して特定の標的タンパク質に対する新規 リガンド設計を競うBioSolveIT Drugathon 2022がオンライン開...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【技術情報】膨大なケミカルスペースに対する超高速類似構造探索
創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール!原理と適用事例につ…
薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactama...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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複数種を取り込んだ計算に対応!新モジュールや各計算エンジンの主な新機能…
「AMS」は、量子化学計算プログラムのADFをはじめとする計算化学統合 パッケージです。 昨年末にリリースされた新バージョン『AMS 2020』では、マルチレイヤーでの QM/MM計算を可能にする新しい計算エンジン"Hybrid "が搭載されました。 「AMS」パッケージ内の任意のQMエンジン、MMエンジンを組み合わせた計算が 可能で、分子系だけでなく、周期系(1~3次元)の取り...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【新製品情報】材料設計支援プラットフォーム SciMAPS4.4
ゼロせん断粘度を推算!表示に関する機能が向上し、大きな系についても高速…
「SciMAPS」は、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 「SciMAPS」には、Quantum、Classical、Engineeringの3つのパッケージがあり、 目的に応じて導入。各パッケージにはその分野で定評のある計算プログラムが 利用できますので、研究目的に合わせて使い分けることが可能です。 当資料では、1...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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他の解析ツールとの連携が容易!分子モデリングや機械学習と組み合わせた解…
BioSolveIT社から、さまざまな創薬支援ツールを『KNIME』上で 利用するためのKNIME Interfaces(23種の解析ノードセット)の 新バージョンがリリースされました。 メディシナルケミスト向けのリード化合物最適化ツールであるSeeSAR等の BioSolveIT社のツールを使った解析が可能です。 当資料ではKNIMEを使ったドッキングシミュレーションの解析例を...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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統合計算化学システム!5名の先生方にMOEを活用した研究事例についてご…
当資料では、日英同時通訳付きウェビナーとして開催した 「MOEフォーラム2020」の招待講演と開発元の講演を紹介します。 生命科学、創薬研究の分野の先端で活躍されている5名の先生方に MOEを活用した研究事例についてご講演いただきました。 また、開発元のCCG社からは、対話的なSAR解析が行える MOEウェブアプリケーションのMOEsaicの機能強化、タンパク質の 開発可能性や...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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分子糊の開発を支援!統合計算化学システム MOE 上で分子糊とタンパク…
当資料では、統合計算化学システムMOE上で動作させる「Molecular Glue Modeling Tool」 について ご紹介しております。 分子糊の開発を支援するMOEのカスタムアプリケーションであり、 2つのアプローチにより分子糊を介した三元複合体構造のモデリングを 容易に行うことが可能。 検証結果なども掲載しており、導入検討の際に参考にしやすい 一冊となっております。ぜひ、ご一読くだ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【技術情報】MOE:SVL Exchange:AutoPH4
リガンド結合部位から自動的にファーマコフォアモデルを作成するアドオンプ…
『SVL Exchange』は、統合計算化学システム「MOE」のアドオンプログラムを 共有するためのウェブサイトです。 300以上のアドオンプログラムが公開されており、それらは簡単に「MOE」に インストールして使用できます。 当資料では、『SVL Exchange』で公開されている「AutoPH4」や、当社開発の アドオンプログラムをご紹介しています。 【掲載内容】 ■...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【技術情報】MedeA-VASP:生成エネルギー自動計算機能
格子振動に起因するエントロピーの値の算出が可能!生成エネルギー自動計算…
「MedeA」は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができます。 当資料では、新しいバージョン『MedeA 3.2』で「MedeA-VASP」 インターフェースに搭載された生成エネルギー自動計算機能について 解説しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-VASPと生成エネルギー自動計算機能 ■生成エネルギーと標準生成エン...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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4つのウィンドウから構成!Expertモードによる入力ファイルの直接編…
「Molpro」は、配置問相互作用法、クラスタ展開法、多配置SCF法、 多配置参照摂動法など、電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を 搭載した量子化学計算ソフトウェアです。 当資料では、「Molpro」のグラフィカルユーザーインターフェース(GUI) 『gmolpro』についてご紹介しています。 是非、ダウンロードしてご覧ください。 【掲載内容】 ■gmolpro の...
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研究開発における知識の共有を促進!より簡単にデータの管理を行えるように…
Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など、 研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合プラットフォームを 提供しています。 電子実験ノート「ELN」、分子情報・アッセイデータ登録システム「RegMol」、 在庫管理システム「Inventory」の各製品では低分子化合物から核酸・ ペプチド・タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や...
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新機能の追加や既存機能の強化は自動的に反映!クラウド型研究データ管理シ…
『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery(CDD)社により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 「CDD VaultとELNモジュールの連携強化」をはじめ、 「ELN へのアッセイアノテーション付与」や「生物製剤情報の管理」、 「数値計算時に不等号を適切に保持」等を2018年に実装。 当資料では、特に重...
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MedeA-Deformation:分子動力学計算による塑性変形の取り…
『MedeA』は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができる材料設計支援統合システムです。 当資料では、塑性領域における物性予測のため、応力ひずみ曲線を 算出するツール「MedeA-Deformation」について、カーボンナノチューブへの 適用事例を交えてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-Deformation...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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ユーザーインターフェース刷新!使いやすさがより向上した創薬支援ツールを…
当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールについて掲載しています。 「SeeSAR」は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との 結合親和性の評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 最近実施されたバージョンアップでは、既存機能...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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FBLDのためのInspirator機能の強化!配列表示機能を改良した…
当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツール『SeeSAR 8.0リリース』について 掲載しています。 『SeeSAR』は、受容体の結合部位内において、リガンド原子の 結合自由エネルギーへの寄与、結合二面角の妥当性、リガンド物性 などを評価できます。 今回のリリースでは、バージョンアップによるFragment Based...
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同時に複数のデータを解析することが可能!4週間無償トライアルにてご評価…
『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインター フェース(GUI)上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで 幅広くご利用いただけます。 当資料では、「Single Cell RNAseqtoolkit」を...
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フラグメントベースのリガンドデザイン機能が強化!SeeSAR 7.2リ…
当資料では、バージョンアップされた創薬支援ツール SeeSAR 7.2について掲載しています。 独BioSolveIT社の「SeeSAR」は、メディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールです。 今回のバージョンアップでは、フラグメントベースのリガンドデザイン機能が 強化され、従来の母核構造置換に加え、フラグメント付加、複数フラグメント の結合によって新規リガ...
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実験データを管理・共有、実験資材情報や参考文献との連携で研究開発を効率…
ChemInnovation Software社製『Chemical and Biological Information System(CBIS)』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、 文献やレポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンス...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンス!CBISの研究資材・…
『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、化合物・試薬や細胞株などの研究資材とその在庫情報を 当製品で管理するメリットについてご...
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