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まさに合成中の「NET-RNA」をインプットするNET-CAGE解析。…
従来の「CAGE」解析では、total RNAをインプットし、以下が可能。 ・RNAの発現解析(一般的なRNA-seqと同じ役割) ・転写開始点の同定(CAGE最大の強み、RNA-seqでは不十分) ・同定した転写開始点データをもとに転写因子結合モチーフの検索(CAGEならでは、ChIP-seqの逆引き機能) ライブラリー作製の中心原理は「キャップトラップ法」、RNA 5'末端のキャップ構...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。
RNA-seqにつきもののバッチエフェクト、具体的な要因をご紹介。...大きく3つの要素について解説しています。 バッチエフェクト1. 解析回の違い、PCR とRNA 断片化 バッチエフェクト2. ライブラリ作製キットの違い バッチエフェクト3. 細胞培養のバッチ違い ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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