解析付きNGS受託サービス、RNAseq 6Gbキャンペーン

データ解析付きの受託サービス。安心のオール国内も可能。RNA-seqい…

当社のNGS受託サービス各種は、初めてでも安心のデータ解析付きです。 発現解析の「RNA-seq」や「CAGE」はTotal RNAを送るだけ、 USBやHDDにて解析データをお届けします。 目的に合わせたrRNA除去やde novoアセンブリもございます。 「CAGE」は「RNA-seq」よりも定量性が高い遺伝子発現解析が可能。 「NET-CAGE」ではエンハンサーRNA解析の...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム

遺伝子発現の受託解析サービス『NET-CAGE』

まさに合成中の「NET-RNA」をインプットするNET-CAGE解析。…

従来の「CAGE」解析では、total RNAをインプットし、以下が可能。 ・RNAの発現解析（一般的なRNA-seqと同じ役割） ・転写開始点の同定（CAGE最大の強み、RNA-seqでは不十分） ・同定した転写開始点データをもとに転写因子結合モチーフの検索（CAGEならでは、ChIP-seqの逆引き機能） ライブラリー作製の中心原理は「キャップトラップ法」、RNA 5'末端のキャップ構...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム

CAGE-seqの実績紹介

成熟miRNAと一次転写産物の発現プロファイルを解析した事例

トランスクリプトーム解析の分野を軸に発展・拡大してきたFANTOMに 大きく貢献した事例をご紹介しています。 FANTOMでは、short RNA-seq解析とCAGE法を用いた多数の初代培養細胞における、 成熟miRNAと一次転写産物の発現プロファイルを解析しました。 さらに、CAGE法によってこれらのプロモーター配列も明らかにしました。 その結果、miRNAのプロモーターは高...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム

テクニカルつぶやき資料_RNA-seq とバッチエフェクト

テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。

RNA-seqにつきもののバッチエフェクト、具体的な要因をご紹介。...大きく3つの要素について解説しています。 バッチエフェクト1. 解析回の違い、PCR とRNA 断片化 バッチエフェクト2. ライブラリ作製キットの違い バッチエフェクト3. 細胞培養のバッチ違い ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム

テクつぶ資料_レプリケイトとN数について

テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。

解析を外注する際に、サンプル数やN数に関する悩みはつきものです。そんなときのヒントとして、ご一読ください。...・組織か培養細胞か ・バイオロジカルレプリケートとテクニカルレプリケートの違い ・サンプルのプール調製などについて ・CAGE-seqとRNA-seqの再現性はどちらが優れているか などについてご紹介。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム