NgS | イプロス医薬食品技術

次世代シーケンサーとマイクロアレイの様々なデータ解析に対応！イルミナ／…

『Partek Genomics Suite』は、次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを統合して解析できるソフトウェアです。数多くのアプリケーションに最適な解析アルゴリズムを搭載しており、幅広い研究目的にご利用いただけます。【次世代シーケンサーの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DN...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

NGSデータ解析ソフトウェア『Partek Flow』

次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行！RNA-seq…

『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq...

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【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出し...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

RNA-seqデータ解析　ユーイング肉腫の解析事例

Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析を…

　Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS／マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています。これらのソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアラインメントからパスウェイを使った生物学的解釈まですべてサポートします。　Partek Flo...

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【新製品情報】シングルセルレパトア解析

シングルセルレパトア解析の事例を紹介！様々なOSのマシンで「Flow」…

『Partek Flow』（以下、Flow）は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列データを読み込んで、遺伝子の発現量やDNAの変異などを解析することができ、T細胞やB細胞に発現しているT細胞受容体（TCR）やB細胞受容体（BCR）の遺伝子配列を調べるレパトア解析が可能。また1細胞レベルでレパトア解析を行うことで、異なる...

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【技術情報】Batchremovalツールによるバッチ効果の低減

バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能についてご紹…

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、 RNA-seqやSingle Cell RNA-seq等のデータを解析することが可能。当資料では、バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能について紹介しています。【掲載内容】 ■Flowの製品概要 ■Batch re...

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【新製品情報】Partek Flow 11.0リリース

解析アプリケーションに合ったデータの取込みをナビゲートすることでデータ…

当資料では、「Partek Flow」の新バージョンでの主な新機能や変更点についてご紹介しております。「Flow」は、ウェブブラウザーを介して利用するNGSデータ解析ソフトウェア。新バージョンではインターフェイスが改良され、空間トランスクリプトーム解析機能が強化。各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。【掲載内容】 ■Partek Flo...

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【技術情報】RNA-seq データ解析

エンリッチメント解析やパスウェイマップの表示が可能！RNA-seqデー…

Partek Flowは、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq等のデータを解析することが可能。 Flowはリード配列の参照ゲノム配列へのアライメント前後の品質保証/ 品質管理（QA/QC）、発現遺伝子量の推定、正規化、発現変動遺伝子の検出など、 RNA-seq データ解析に必要な機能...

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【技術情報】Flow：DNA-seqデータ解析

DNA-seqやSNVおよびIndelの検出など！Flowを用いたデー…

当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、データ解...

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【新製品情報】新規遺伝子発現データ解析パイプラインの追加

次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアの追加機能と活用例についてご紹…

『Partek Flow（以下、Flow）』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。次世代シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列データを読み込んで、Single Cell RNA-Seqや空間的遺伝子発現等のデータを解析することが可能です。 Flowでは、Single Cell RNA-Seqデータの解析を行うCell Rangerと、空間的遺伝子発現データの...

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【新製品情報】Sample Composition Tools

新しい解析ツールであるSample Composition Tools…

GENEVESTIGATORは遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサー（NGS）の膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。当資料では新しい解析ツールであるSample Composition Toolsや新たに追加された遺伝子発...

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