NgS | イプロス医薬食品技術

モザイク変異を詳細に解析！Illumina MiSeqを使用したジェノ…

ファスマックでは、『PCR-NGS解析』を承っております。次世代シークエンサーを用いて変異の種類と頻度を詳細に解析。解析装置は「Illumina MiSeq」を使用し、1つのターゲットサイト（16サンプルまで）をまとめて解析します。価格、納期など詳細に関しては、お気軽にお問い合わせください。【解析詳細】 ■1つのターゲットサイト16サンプルをまとめて解析 ■...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)

迅速かつ高精度！7つの遺伝子領域を同時に同定し菌のタイピングを行う方法…

ファスマックでは、『微生物タイピングサービス(NGS MLST解析サービス)』を承っております。「MLST解析」とは、複数の遺伝子領域(通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法で、16srRNA遺伝子解析では判別できなかった詳細な株の情報が得られます。 NGSを利用した「MLST解析」はショットガンゲノムシークエンスにより得られた配列データを近...

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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。外来DNAの挿入位置の決定…

『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。【特長】 ■目的・ターゲットにあわ...

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ジェノタイピング解析

PCR-電気泳動解析やPCR-NGS解析など！リアルタイムPCR、デジ…

「ジェノタイピングやらなきゃいけないけど時間が無い」とお悩みの皆様、手間のかかる作業はファスマックにお任せください。当社の『ジェノタイピング解析』では、DNA抽出、PCR、変異検出を行います。マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等をお送りください。ご希望の検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。また、リアルタイムPCR、デジタルPCRによる検出...

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【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出

ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します！

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの検出を試みました。ノックインに用いたドナーDNAが目的とした9番染色体(chr9)に加えて、別の染色体へも挿入されていることが示唆されまし...

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DNAランダムインテグレーション解析

短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析

外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランス...

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抗体配列シーケンス解析

オプション作業を承ることも可能！組み換え抗体の作製をサポートいたします

ファスマックでは、『抗体配列シーケンス解析』を承っております。抗体可変配列の取得により、組み換え抗体の作製をサポート。ハイブリドーマに発現するマウスIgG遺伝子可変配列を5’RACE法、またはRT-PCRにより増幅、大腸菌でDNAクローニングを行いシーケンス解析します。その他、場合によりその他オプション作業を承ることも可能です。ご相談ください。【解析詳...

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ジェノタイピング解析　※解析事例集進呈中

マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等からDNA抽出、…

大規模スクリーニングや1検体ごとの詳細解析等、ご要望に合わせた解析が可能です。検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。 ...DNAの抽出や精製、PCR、電気泳動(アガロース、キャピラリー電気泳動)、シーケンス解析(サンガー、NGS)等、目的に合わせた解析をご提案いたします。...

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【解析事例】動物培養細胞、植物細胞の挿入部位の決定

RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配列へマッピングを行いました。結果とし...

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【解析事例】HTLV-1クロナリティ解析

高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて...

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【次世代シーケンス解析事例】12Sアンプリコン解析

検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…

魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて解析した例をご紹介いたします。相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバン消毒液を1ml/L添加。常温で持ち帰り、ラボにてフィルトレーション、DNA抽出などを行い、得られたデータをMitoFishに供与してホモロジー検索を行いました。その結果、...

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RNA-seq解析　※解析事例集進呈中

ライブラリー作製からデータ解析まで！ファスマックのRNA-seq解析を…

ファスマックでは、『RNA-seq解析』を承っております。「RNA-seg」は、NGSを利用しmRNAを解析することによって細胞内で発現する全転写物の網羅的な定量が可能。全転写物の発現量を定量するには、まずサンプルから転写物であるRNAを抽出し断片化を行い、断片化RNAからcDNAライブを作成してシークエンスを行います。また、お客様の実験プランに応じて解析内容...

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