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『SimGlycan』 糖鎖&糖ペプチド構造解析ソフトウェア
糖鎖および糖ペプチドの質量分析データを用いたグライコミクス向けツール
SおよびMSnデータを自動で読み取り糖鎖構造を予測します。さらに、LC-MS/MSデータを用いた糖ペプチド分析を包括的にサポートします。SimGlycanは実験で得られたMS/MSデータを独自のデータベースと照合し、最終的に候補構造のリストをランク付きで生成します。...
メーカー・取り扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
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BLASTによるDNA塩基配列の検索、HMMERによるタンパク質のドメ…
によるタンパク質のドメイン検索を行うためのマシン構成です。 複数のユーザーが有線LAN経由でマシンにアクセスする使い方を想定しています。 また、BLASTでのクエリ配列は数百から数千程度で、データベース配列は10万程度。HMMERによるドメイン検索は、10万程度のクエリ配列を想定しています。 de novo解析の実行も可能な構成ですが、優先度の高い要件として考慮する場合には、仕様上の最大...
メーカー・取り扱い企業: テガラ株式会社
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