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類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール
『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現!
ストセットとして 86%以上で X 線結晶構造を再現 ■様々な分子系に適用可能(タンパク質-低分子、タンパク質-ペプチド、 タンパク質-糖、DNA-低分子など) ■ファーマコフォア、部分構造の位置拘束によるポケットへの配置 ■受容体ポケットが不明な場合は、探索された全ポケットについて網羅的 なドッキングが可能 ■化合物や受容体の全体もしくは受容体の一部を剛体とした構造最適化計算 ■M...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…
グメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウス...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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