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まさに合成中の「NET-RNA」をインプットするNET-CAGE解析。…
・転写開始点の同定(CAGE最大の強み、RNA-seqでは不十分) ・同定した転写開始点データをもとに転写因子結合モチーフの検索(CAGEならでは、ChIP-seqの逆引き機能) ライブラリー作製の中心原理は「キャップトラップ法」、RNA 5'末端のキャップ構造を捉える理研開発の独自技術です。 この「NET-CAGE」解析では、今まさに核内で合成中の「NET-RNA」を独自技術で抽出回...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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RNA-seqに比べ約7倍の高感度!PCRフリーで転写開始点を正確に同…
pシングルエンド、1サンプルあたり通常約2,000万リードのデータ量を取得 ◎解析パッケージはサンプルRNAの品質検査、ライブラリー作成、シーケンス、データ解析、データ発送を含む ◎ライブラリー作製は、キャップトラッパー法による ◎NGSシーケンスは、イルミナNextSeq/HiSeqによる ◎RNAの5‘末端から75塩基をシーケンス 【用途】 ◎遺伝子の発現解析 ◎新規バイオマー...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。
大きく3つの要素について解説しています。 バッチエフェクト1. 解析回の違い、PCR とRNA 断片化 バッチエフェクト2. ライブラリ作製キットの違い バッチエフェクト3. 細胞培養のバッチ違い ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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