テクニカルつぶやき資料_RNA-seq とバッチエフェクト

テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。

大きく3つの要素について解説しています。 バッチエフェクト1. 解析回の違い、PCR とRNA 断片化 バッチエフェクト2. ライブラリ作製キットの違い バッチエフェクト3. 細胞培養のバッチ違い ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダナフォーム

CAGE-seqの実績紹介

成熟miRNAと一次転写産物の発現プロファイルを解析した事例

トランスクリプトーム解析の分野を軸に発展・拡大してきたFANTOMに 大きく貢献した事例をご紹介しています。 FANTOMでは、short RNA-seq解析とCAGE法を用いた多数の初代培養細胞における、 成熟miRNAと一次転写産物の発現プロファイルを解析しました。 さらに、CAGE法によってこれらのプロモーター配列も明らかにしました。 その結果、miRNAのプロモーターは...

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テクつぶ資料_レプリケイトとN数について

テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。

・組織か培養細胞か ・バイオロジカルレプリケートとテクニカルレプリケートの違い ・サンプルのプール調製などについて ・CAGE-seqとRNA-seqの再現性はどちらが優れているか などについてご紹介。...

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