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手持ちの配列にNCBIのBLASTが簡単に実行できるアプリケーションで…
次世代シーケンサから得られたプライベートなmRNAやGenome、アミノ酸の配列に対して、WindowsやMacなどのモバイルPC上で、BLAST検索作業を簡単に行うことができるアプリケーションです。 ・インストーラで簡単インストール ・すべての機能をマウスで操作 ・複数の配列セットをデータベースとして登録 ・複数のクエリ配列とそのBLA...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社メイズ
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GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現…
『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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クローニング・ツール Gene Construction Kit
DNA 配列の構築・編集とプラスミドマップの作成
グラフィカル・インターフェースによる DNA 配列の直接編集。 ・PCR プライマーの同定、および、それらを特性としてコンストラクトに追加。 ・一度入力するだけで複数のオンライン・データベースを検索可能(KEGG, PubMed, PDB, GO, EntrezGene など)。 ・カット&ペースト時における DNA 末端の自動モニタリングと調整。 ・GenBank および EMBL ファ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ヒューリンクス
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GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…
【特長】 ■膨大な遺伝子発現データ ■高速な検索エンジン ■使いやすいインターフェース ■マニュアルキュレーション ■高品質なデータ ■データの正規化 ■定期的なデータ更新 ■あらゆるマシンで使用可能 【主な対応プラットフォーム...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…
『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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DNA 配列のアセンブリ 『CodonCode Aligner』
DNA 配列のアセンブリとアラインメント
・テキストファイルからのシーケンスの読み込み ・End Clip 機能 (低品質のシーケンス末端を切り取る機能) ・コンティグのアセンブル ・ヘテロ接合型突然変異の検索 ・Phrap で作成されたアセンブリの読み込みと編集 ・サンプル名に基づくグループ単位のアセンブルや整列 ・ヘテロ接合性の挿入と欠失の分析 ・プロジェクトから直接 Phred および Ph...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ヒューリンクス
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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』
国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定…
Aの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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【製品紹介】遺伝子発現データベース GENEVESTIGATOR
データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reducti…
や次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析が可能。 また、当ツールは使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを 搭載しているため、研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を 行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを 簡単かつ正確に行うことができます。 当資...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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