DNAランダムインテグレーション解析

『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。
少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。

ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、
創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、
ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、
外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。

【特長】
■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能
■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能
■独自技術により再現性の高い結果が得られる

【解析事例】
◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析
少ないDNA量で素早く検出できるRAISING法の特長を活かし、
プロウイルス量0.032％でも高い検出感度を実現しています。

◎ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出
CRISPR/Casで作製したノックインマウスについて、NGSとの組み合わせにより
ノックイン効率とオフターゲットサイトの検出を行いました。

※事例やサービスの詳細は「ダウンロード」から資料をご覧ください。 （詳細を見る）

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの
事例をご紹介します。

HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、
そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。

現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を
用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて
おりますが、大量のDNA(血液)を要する、長時間で複雑な工程を必要とする、
検出感度は十分ではないなど種々の問題を抱えています。

RAIS法は、これらの問題を全て克服した方法であり、HTLV-1クロナリティ解析に
おいては高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られております。

【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】
■サンガーシーケンスプラン
■次世代シーケンス(NGS)プラン

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの
事例をご紹介します。

CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および
NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの
検出を試みました。

ノックインに用いたドナーDNAが目的とした9番染色体(chr9)に加えて、
別の染色体へも挿入されていることが示唆されました。

【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】
■サンガーシーケンスプラン
■次世代シーケンス(NGS)プラン

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの
事例をご紹介します。

アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配列へマッピングを行いました。

結果として、動物培養細胞、ならびに植物細胞への挿入位置決定として本手法が有効である事が確認出来ました。

【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】
■サンガーシーケンスプラン
■次世代シーケンス(NGS)プラン

※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
※事例については下記のURLをご参照ください。 （詳細を見る）