株式会社ジーンベイ　会社案内

当社では、Oxford Nanopore Technologies社のナノポアシーケンサーを用いた
各種シーケンス受託サービスを提供しております。

同社が提供するシーケンサーは、DNA分子やRNA分子がポリマー製の膜に
埋め込まれたタンパク質のナノポアを通過する際に起こる電流の変化を計測します。

既存のシーケンサーで使用されていた蛍光色素やDNAポリメラーゼを
使用しないことから、装置の小型化に成功するとともに、非常に長い配列が
得られることが特長です。

【提供サービス】
■全ゲノムシーケンス
■全トランスクリプトームシーケンス
　・cDNA-seq
　・direct RNA-seq

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当社では、DNAサンプルをお送りいただくことでGRAS-Di(R)用ライブラリ調整、
シーケンス、データ解析を行います。

次世代シーケンサーを利用した新規マーカー技術GRAS-Di(R)(Genotyping
by Random Amplicon Sequencing-Direct)は、ランダムプライマーを用いた
PCR増幅により、ゲノムの複数箇所を配列決定し、ジェノタイピングを行う
新規手法です。

マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図等に利用できます。

【GRAS-Di(R)の特長】
■アンプリコンの増幅効率の再現性が良いため欠損値を軽減
■ランダムPCRによるゲノムワイドな断片増幅を実現

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当社では、MGI Tech社のMGISEQ-2000(DNBSEQ-G400)を用いた国内での
受託解析サービスを行っています。

DNBSEQは環状化された一本鎖DNAをテンプレートとし、ローリングサークル
増幅(RCA)によって調整されたライブラリーをシーケンスします。

他の既存のシーケンスプラットフォームで発生する、ライブラリー増幅時の
PCRエラー蓄積やGCバイアスを軽減するだけでなく、PCR重複やインデックス
ホッピングといった問題を低減します。

【サービス内容】
■全ゲノムシーケンス(WGS)
■RNAシーケンス(stranded mRNA-seq)
■stLFR(single tube Long Fragment Read)シーケンス
■ライブラリー提出によるレーンシーケンス

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『GGM(GenaGenomeManager)』は、増え続けるNGSデータの管理、閲覧、
解析をトータルにサポートするデータストレージシステムです。

登録したBAMデータをもとに自由な組み合わせでのプロジェクト作成、
バリアントの検出、発現情報解析が可能であり、結果をグラフィカルに
検索・閲覧することができます。

また、形質情報等のメタデータを登録することで、形質と相関する
バリアントや発現変動遺伝子などの探索が容易に行えます。

【製品概要】
■1000サンプル規模のデータを登録可能な、サーバ一体型システム
■軽くてわかり易いインターフェースで、複数のデータを容易に比較
■不要になったデータは、外部ハードディスクでオフライン保管
■ユーザー数制限なし、それぞれのパソコンで何人でも使用可能
■ワークスペース単位でのアクセス制限によりデータの機密保持にも対応　など

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当カタログは、株式会社ジーンベイが提供する解析システム及び次世代
シークエンスサービスを掲載した総合カタログです。

NGSデータの効率的な蓄積・管理・解析を可能にするハードウェア一体型
システム「GenaGenomeManager(TM)」をはじめ、ゲノムデータベース
クラウド「GiNeS」、その他シーケンスデータ解析クラウドサービスなど、
様々なシステムやサービスをご紹介しております。

【掲載内容】
■解析システム
■次世代シークエンスサービス

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