株式会社ダナフォーム
最終更新日:2022-08-18 20:11:20.0
テクつぶ資料_CAGEとRNAseqどちらにしよう
基本情報テクつぶ資料_CAGEとRNAseqどちらにしよう
テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。
次世代シーケンサーを使用したRNAの発現解析、知名度でいえばRNA-seq。似た手法にCAGE-seqがあり、定量性感度はこちらのほうが良いとの評判もあります。
両者の共通点や違いを、受託解析メーカーの目線でご紹介いたします。
解析付きNGS受託サービス、RNAseq 6Gbキャンペーン
当社のNGS受託サービス各種は、初めてでも安心のデータ解析付きです。
発現解析の「RNA-seq」や「CAGE」はTotal RNAを送るだけ、
USBやHDDにて解析データをお届けします。
目的に合わせたrRNA除去やde novoアセンブリもございます。
「CAGE」は「RNA-seq」よりも定量性が高い遺伝子発現解析が可能。
「NET-CAGE」ではエンハンサーRNA解析の新技術です。
他にも「ATAC-seq」、「ChIP-seq」、「WES」、「WGS」、など。
MGI DNBSEQシーケンサーも2021年秋から本格始動。
2022年秋に増設、イルミナNextSeq2000を導入しました。
【特長】
■RNA-seqの提出RNAは total RNA 1ug
■RNA-seq、ヒトやマウスのとき10ngスタートも可能
■まさに1細胞を解析、Ultra Low なRNA-seqも人気プラン
■RNA抽出オプション
■目的に合わせた不要RNA除去やde novoアセンブリもご用意
※解析条件のアレンジはお気軽にお問い合わせ下さい。 (詳細を見る)
小冊子『RNA-seqガイド(1)入門編』
当社では『RNA-seq解析の受託サービス』をご提供しています。
NGS解析ならではのゲノムワイドな発現解析が行え、
低発現遺伝子から高発現遺伝子まで網羅的な検出が可能。
新規の転写産物やスプライシングバリアントの探索なども行えます。
また、最短納期が「3週間」のプランをご用意。
(解析条件が50+25bpペアエンド、もしくは75bpペアエンドの場合)
他にもニーズに合わせたご提案が可能です。
【特長】
■企業・研究機関・大学など産官学を問わず様々な機関で活躍
■真核生物、原核生物を問わず、RNAを持つ生物種なら解析可能
■ChIP-seqと併用することで発現量から転写因子の働きを確認可能
※RNA-seqの原理やメリットをわかりやすく紹介した資料を進呈中!
詳しくはPDFダウンロードよりご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。 (詳細を見る)
小冊子『FAQでみる 遺伝子発現解析方法の違い』
遺伝子の研究に欠かせない、遺伝子解析および遺伝子検査。
様々な解析方法の違い
当社からCAGEのメリット、他の解析法との比較について開設した、
FAQ形式の小冊子『FAQでみる 遺伝子発現解析方法の違い』を無料プレゼント中!
CAGEって何だろう?という、ぼんやりとした疑問が、
CAGEっていいかも!という、ふんわりとした希望へと変わるかもしれません。
解析の原理や、必要なRNAサンプル量も分かります。
【FAQ掲載例】
■マイクロアレイに対してのメリットは何ですか?
■ChIP-seqとの相性はどうですか?
■Total RNAはどのように送付したらよいですか?
※下記の「PDFダウンロード」ボタンからご覧いただけます。
※お問い合わせもお気軽にどうぞ。
(詳細を見る)
受託解析『RNA-seq』※初心者向け小冊子を進呈
『RNA-seq』は、次世代シークエンシング解析の一つで、
トランスクリプトームと呼ばれる遺伝子発現を網羅的に検出する手法です。
様々な生物種に対応し、遺伝子および転写産物の発現レベルと
スプライシングパターンの解析を行うことができます。
モデル生物であれば最短3~4週間の短納期で結果の納品が可能。
納品時にはデータ確認ガイド(手引き冊子)が付属するため、初心者でも安心です。
【特長】
■価格を抑えたプランや、DNBseqシーケンス受託サービスもご用意
■新規転写産物の同定
■Total RNA 1μgまたは10ngスタートが可能
■モデル生物を始めとした様々な生物種で実績あり
(ヒト、マウス、植物、魚、カエル、酵母、バクテリアなど)
※原理やメリットをわかりやすく紹介した小冊子を進呈中。
「PDFダウンロード」よりスグにご覧いただけます。 (詳細を見る)
受託解析『RNA-seq』※基礎から分かる小冊子進呈!
『RNA-seq』は、NGSシークエンシング受託解析の一つで、
遺伝子の発現解析(トランスクリプトーム)を網羅的に行う手法です。
様々な生物種に対応、遺伝子および転写産物の発現レベルと
スプライシングパターンの解析を行うことができます。
■トランスクリプトームの網羅的解析
■遺伝子および転写産物の発現レベルとスプライシングパターンの解析
■新規転写産物の同定
■モデル生物を始めとした様々な生物種で実績があります。
(例. ヒト、マウス、植物、魚、カエル、酵母、バクテリアなど)
当社では独自技術の受託解析サービス『CAGE-seq』も提供しております。
■PCRフリーのため定量性に優れ、検出感度はRNA-seq解析に比べ約7倍
■RNAの転写開始点検出に強みがあります
■モデル生物を始め、ゲノム情報の有る真核生物に
■がんと疾患で転写開始点の使い分けが分かり、バイオマーカー候補探索に活用した使用例も
※原理やメリットをわかりやすく紹介した小冊子を進呈中。
RNA-seqとCAGE-seqについて、両者の違い、技術や価格をFAQ形式で分かりやすく紹介しています。 (詳細を見る)
遺伝子発現の受託解析サービス『CAGE』
当社では、mRNAやncRNAなどの発現を転写開始点ごとに
定量解析する技術『CAGE』による受託解析サービスを提供しています。
RNA-seq解析に比べ約7倍の検出感度を有し、
PCRフリーのため定量性に優れ、網羅的な発現量データが得られます。
解析もしっかりフォロー。
納品データは、発現量や発現比較、クラスタリングなどを標準セットにしています。
サンプルRNAの品質確認やデータ解析は、基本サービスとなり、追加費用はありません。
初めての方や、データ解析が心配な方にもお勧めです。
【特長】
■理化学研究所と当社の共同開発技術
■転写開始点をゲノムワイドに定量解析
■遺伝子だけでなく、プロモーターの網羅的な発現解析も実現
■プロモーター単位での遺伝子発現ネットワーク探索も可能に
■転写因子結合モチーフ探索を標準で実施
■価格は1サンプルあたり、解析込みで約10万円
※製品の詳細は、下記よりPDF資料をご覧ください。
※小冊子『FAQでみる遺伝子発現解析方法の違い』も
下記より無料でダウンロードして頂けます。 (詳細を見る)
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