テクつぶ資料_RNAseqとバッチエフェクト

当社のNGS受託サービス各種は、初めてでも安心のデータ解析付きです。

発現解析の「RNA-seq」や「CAGE」はTotal RNAを送るだけ、
USBやHDDにて解析データをお届けします。
目的に合わせたrRNA除去やde novoアセンブリもございます。

「CAGE」は「RNA-seq」よりも定量性が高い遺伝子発現解析が可能。
「NET-CAGE」ではエンハンサーRNA解析の新技術です。
他にも「ATAC-seq」、「ChIP-seq」、「WES」、「WGS」、など。

MGI DNBSEQシーケンサーも2021年秋から本格始動。
2022年秋に増設、イルミナNextSeq2000を導入しました。

【特長】
■RNA-seqの提出RNAは total RNA 1ug
■RNA-seq、ヒトやマウスのとき10ngスタートも可能
■まさに1細胞を解析、Ultra Low なRNA-seqも人気プラン
■RNA抽出オプション
■目的に合わせた不要RNA除去やde novoアセンブリもご用意

※解析条件のアレンジはお気軽にお問い合わせ下さい。 （詳細を見る）

CAGE-seqとRNA-seq、両者それぞれ良さもあり、違いもあります。 （詳細を見る）

『RNA-seq』は、NGSシークエンシング受託解析の一つで、
遺伝子の発現解析（トランスクリプトーム）を網羅的に行う手法です。

様々な生物種に対応、遺伝子および転写産物の発現レベルと
スプライシングパターンの解析を行うことができます。

■トランスクリプトームの網羅的解析
■遺伝子および転写産物の発現レベルとスプライシングパターンの解析
■新規転写産物の同定
■モデル生物を始めとした様々な生物種で実績があります。
（例. ヒト、マウス、植物、魚、カエル、酵母、バクテリアなど）

当社では独自技術の受託解析サービス『CAGE-seq』も提供しております。
■PCRフリーのため定量性に優れ、検出感度はRNA-seq解析に比べ約7倍
■RNAの転写開始点検出に強みがあります
■モデル生物を始め、ゲノム情報の有る真核生物に
■がんと疾患で転写開始点の使い分けが分かり、バイオマーカー候補探索に活用した使用例も

※原理やメリットをわかりやすく紹介した小冊子を進呈中。
RNA-seqとCAGE-seqについて、両者の違い、技術や価格をFAQ形式で分かりやすく紹介しています。 （詳細を見る）

当社では、mRNAやncRNAなどの発現を転写開始点ごとに
定量解析する技術『CAGE』による受託解析サービスを提供しています。

RNA-seq解析に比べ約7倍の検出感度を有し、
PCRフリーのため定量性に優れ、網羅的な発現量データが得られます。

解析もしっかりフォロー。
納品データは、発現量や発現比較、クラスタリングなどを標準セットにしています。

サンプルRNAの品質確認やデータ解析は、基本サービスとなり、追加費用はありません。

初めての方や、データ解析が心配な方にもお勧めです。

【特長】
■理化学研究所と当社の共同開発技術
■転写開始点をゲノムワイドに定量解析
■遺伝子だけでなく、プロモーターの網羅的な発現解析も実現
■プロモーター単位での遺伝子発現ネットワーク探索も可能に
■転写因子結合モチーフ探索を標準で実施
■価格は1サンプルあたり、解析込みで約10万円

※製品の詳細は、下記よりPDF資料をご覧ください。
※小冊子『FAQでみる遺伝子発現解析方法の違い』も
　　下記より無料でダウンロードして頂けます。 （詳細を見る）