MOLSIS ニュースレター　第６号リリース

次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行！RNA-seqをはじめ様々なアプリケーションのデータ解析に対応！

『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq…

ひろがる領域、ひろがる可能性！様々な平衡物性を推算することができるソフトウェア

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフトウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡物性を推算することができます。 COSMO-RS法は、量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出します。そして、得られた化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 …

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分け…

力場パラメータの問題を解決！高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア

『Direct Force Field』は、”さまざまな分子シミュレーションソフトウェアに高精度な力場パラメータを提供すること”を目的に開発された製品です。 独自の手法によりパラメータの代用の問題を解決し、分子系に最適な力場パラメータをアサインすることが可能です。また、登録されている力場パラメータは、開発者のCOMPASS等の力場開発における経験と知識に基づいて、作成、検証されています。その…

予測結果を証拠の重み付けにより評価！全体の不確実性を最小限に抑える！

『ChemTunes＆ToxGPS』は、化合物の安全性評価とリスク評価のための 毒性・安全性に関連するデータベース（ChemTunes）と、知識ベースの 予測・ワークフローシステム（ToxGPS）を統合したプラットフォームです。 QSARモデルとケモタイプ・アラートの両方の予測結果を証拠の重み付けにより 評価することで全体の不確実性を最小限に抑え、最終的な結果を予測します。 医薬…