株式会社ファスマック 【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析
- 最終更新日：2021-11-12 14:32:59.0
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外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であることを見出しました！※解析事例集進呈中
京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの
多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。
当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。
本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことで
ホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストである
ハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。
ブロッキングプライマーを用いた解析手法が、外見から検出が困難な
ホストと寄生者の関係を解明する上で有効な手段であることを見出しました。
【事例概要】
■ブロッキングプライマー存在下/非存在下でPCRを実施
■ハマキホソガ幼虫274検体についてCOIアンプリコン解析をMiseqにて実施
■得られたリードから、ハマキホソガ10種と寄生蜂13種を同定し、
ホスト-寄生者の関係を解明
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基本情報【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析
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○食品の遺伝子検査 ○食品検査試薬の販売 ○遺伝子工学用試薬の製造・販売 ○DNA解析サービス 〇各種受託サービス（DNA合成、遺伝子合成他） 〇ゲノム編集ツール 〇次世代シーケンス解析 〇プライマー/遺伝子合成 〇各種検査サービス 〇試薬キット販売 〇監査・コンサルティング
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