MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ■水素原子付加状態の決定 ■ポケット探索 ■フラグメント結合位置検索 ■結合部位中での分子設計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析 ■母核置換とのフラグメントベースの分子設...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

アを 　選択するだけで簡単にピーク検出を実行 ■アノテーション ・転写開始点から見たプロモーター領域の上限下限および遺伝子データ 　ベースを選択するだけで、　検出したピークに対して遺伝子との位置 　関係のアノテーションを付加 ・ヒトやマウスなど代表的な生物種のRefSeqやEnsemblといった遺伝子 　データベースを自動的にダウンロード ■TSSプロット ・TSSを中心にしたプ...

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『MOE-AutoGPA』による3D-QSAR解析

MOEにCoMFA法/CoMSIA法による3D-QSAR解析を追加。化…

広い特性を用いたCoMSIA法をサポートします。 【特長（AutoGPAのCoMSIA法）】 ■多様な物理化学的特性を3D-QSAR式に含める ■3D-QSAR 式の各特性の係数の大きさと位置から、物理化学的な特性を予測 ■CoMFA法と比較して、より具体的な特性の予測が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

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ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造...

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『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム

リガンドの結合様式を予測！より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現！

ストセットとして 86％以上で X 線結晶構造を再現 ■様々な分子系に適用可能（タンパク質-低分子、タンパク質-ペプチド、 タンパク質-糖、DNA-低分子など） ■ファーマコフォア、部分構造の位置拘束によるポケットへの配置 ■受容体ポケットが不明な場合は、探索された全ポケットについて網羅的 なドッキングが可能 ■化合物や受容体の全体もしくは受容体の一部を剛体とした構造最適化計算 ■M...

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FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

グメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウス...

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