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Partek社のNGS/マイクロアレイデータ解析ソフトウェア
次世代シーケンサーとマイクロアレイの様々なデータ解析に対応!イルミナ/…
『Partek Genomics Suite』は、次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを統合して解析できるソフトウェアです。数多くのアプリケーションに最適な解析アルゴリズムを搭載しており、幅広い研究目的にご利用いただけます。 【次世代シーケンサーの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析(RNA-seq) ■miRNA発現解析(miRNA-seq) ■ゲノムリシーケンス解析(DN...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行!RNA-seq…
『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析(RNA-seq, Single Cell RNA-seq) ■miRNA発現解析(miRNA-seq) ■ゲノムリシーケンス解析(DNA-seq) ■転写因子結合部位解析(ChIP-seq) ■メチル化部位解析(MeDIP-seq...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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モザイク変異を詳細に解析!Illumina MiSeqを使用したジェノ…
ファスマックでは、『PCR-NGS解析』を承っております。 次世代シークエンサーを用いて変異の種類と頻度を詳細に解析。 解析装置は「Illumina MiSeq」を使用し、1つのターゲットサイト (16サンプルまで)をまとめて解析します。 価格、納期など詳細に関しては、お気軽にお問い合わせください。 【解析詳細】 ■1つのターゲットサイト16サンプルをまとめて解析 ■...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得!バイアスのない精確な解析が可能!
「Flow」は、次世代シーケンサー(以下、NGS)から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出し...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』
国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定…
『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析を…
Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS/マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています。これらのソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアラインメントからパスウェイを使った生物学的解釈まですべてサポートします。 Partek Flo...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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PCR-電気泳動解析やPCR-NGS解析など!リアルタイムPCR、デジ…
「ジェノタイピングやらなきゃいけないけど時間が無い」とお悩みの皆様、 手間のかかる作業はファスマックにお任せください。 当社の『ジェノタイピング解析』では、DNA抽出、PCR、変異検出を行います。 マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等をお送り ください。ご希望の検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。 また、リアルタイムPCR、デジタルPCRによる検出...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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ワイルドフュージョン バイオインフォマティクス 総合カタログ
初歩的な遺伝子解析ツールから次世代シーケンスデータ解析ツールまでを網羅…
当カタログは、主にファーマコジノミクス関連ソフトウエアやデータベースの開発などを行っている株式会社ワールドフュージョンのバイオインフォマティクスを紹介する総合カタログです。初歩的な遺伝子解析ツールから次世代シーケンスデータ解析ツールまでを網羅したデスクトップ型解析ソフトウェア「CLC Genomics Workbench」をはじめ「Biomedical Genomics Workbench」や「M...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ワールドフュージョン
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すべての生命科学者のためのソフトウェア
DNASTAR社 Lasergene は、最先端の研究を行う生命科学者のための革新的で使いやすいデスクトップソフトウェアです。分子生物学、ゲノミクス、構造生物学の研究に必要なすべてのツールを備えており、バーサタイルなフルパッケージまたは各分野に必要なツールをまとめたスイートパッケージとして利用できます。1984年以来ソフトウェア開発を続け、現在では全世界90か国以上にユーザーを持っています。Las...
メーカー・取り扱い企業: シップスバイオサイエンス株式会社
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【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出
ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します!
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの 検出を試みました。 ノックインに用いたドナーDNAが目的とした9番染色体(chr9)に加えて、 別の染色体へも挿入されていることが示唆されまし...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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シングルセルレパトア解析の事例を紹介!様々なOSのマシンで「Flow」…
『Partek Flow』(以下、Flow)は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列データを読み込んで、 遺伝子の発現量やDNAの変異などを解析することができ、T細胞やB細胞に 発現しているT細胞受容体(TCR)やB細胞受容体(BCR)の遺伝子配列を 調べるレパトア解析が可能。 また1細胞レベルでレパトア解析を行うことで、異なる...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【技術情報】Batchremovalツールによるバッチ効果の低減
バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能についてご紹…
『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列を読み込んで、 RNA-seqやSingle Cell RNA-seq等のデータを解析することが可能。 当資料では、バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Flowの製品概要 ■Batch re...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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オプション作業を承ることも可能!組み換え抗体の作製をサポートいたします
ファスマックでは、『抗体配列シーケンス解析』を承っております。 抗体可変配列の取得により、組み換え抗体の作製をサポート。 ハイブリドーマに発現するマウスIgG遺伝子 可変配列を5’RACE法、 またはRT-PCRにより増幅、大腸菌でDNAクローニングを行い シーケンス解析します。 その他、場合によりその他オプション作業を承ることも可能です。 ご相談ください。 【解析詳...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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解析アプリケーションに合ったデータの取込みをナビゲートすることでデータ…
当資料では、「Partek Flow」の新バージョンでの主な新機能や 変更点についてご紹介しております。 「Flow」は、ウェブブラウザーを介して利用するNGSデータ解析 ソフトウェア。新バージョンではインターフェイスが改良され、 空間トランスクリプトーム解析機能が強化。 各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Partek Flo...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配列へマッピングを行いました。 結果とし...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる!HTLV-1クロナリティ…
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、 そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。 現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を 用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ファスマック
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エンリッチメント解析やパスウェイマップの表示が可能!RNA-seqデー…
Partek Flowは、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq等のデータを解析することが可能。 Flowはリード配列の参照ゲノム配列へのアライメント前後の品質保証/ 品質管理(QA/QC)、発現遺伝子量の推定、正規化、発現変動遺伝子の検出など、 RNA-seq データ解析に必要な機能...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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DNA-seqやSNVおよびIndelの検出など!Flowを用いたデー…
当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。 「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー(NGS)から出力された リード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。 検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、 データ解...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアの追加機能と活用例についてご紹…
『Partek Flow(以下、Flow)』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア です。次世代シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列データを 読み込んで、Single Cell RNA-Seqや空間的遺伝子発現等のデータを解析 することが可能です。 Flowでは、Single Cell RNA-Seqデータの解析を行うCell Rangerと、 空間的遺伝子発現データの...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【新製品情報】Sample Composition Tools
新しい解析ツールであるSample Composition Tools…
GENEVESTIGATORは遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサー(NGS) の膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では新しい解析ツールであるSample Composition Toolsや 新たに追加された遺伝子発...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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