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RNA-seqに比べ約7倍の高感度!PCRフリーで転写開始点を正確に同…
当社では、mRNAやncRNAなどの発現を転写開始点ごとに 定量解析する技術『CAGE』による受託解析サービスを提供しています。 RNA-seq解析に比べ約7倍の検出感度を有し、 PCRフリーのため定量性に優れ、網羅的な発現量データが得られます。 解析もしっかりフォロー。 納品データは、発現量や発現比較、クラスタリングなどを標準セットにしています。 サンプルRNAの品質確認...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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SNP解析を1本のプローブで!目的のDNA配列を特異的に定量でき、塩基…
『Eprobe/Eprimer』は、1本鎖の状態では消光していますが 相補鎖と特異的にハイブリダイズすることにより蛍光を発するため、 PCR法やSmartAmp法に適用すると、極めてシャープに 目的の核酸配列を検出できる蛍光プローブです。 SNP解析が、1本のプローブで1チューブで可能です。 未標識のオリゴDNAに比べTmが高く、PCRクランピング法による 微量体細胞変異の検出が可...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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まさに合成中の「NET-RNA」をインプットするNET-CAGE解析。…
従来の「CAGE」解析では、total RNAをインプットし、以下が可能。 ・RNAの発現解析(一般的なRNA-seqと同じ役割) ・転写開始点の同定(CAGE最大の強み、RNA-seqでは不十分) ・同定した転写開始点データをもとに転写因子結合モチーフの検索(CAGEならでは、ChIP-seqの逆引き機能) ライブラリー作製の中心原理は「キャップトラップ法」、RNA 5'末端のキャップ構...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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テクニカルつぶやき資料、読み物シリーズです。
RNA-seqにつきもののバッチエフェクト、具体的な要因をご紹介。...大きく3つの要素について解説しています。 バッチエフェクト1. 解析回の違い、PCR とRNA 断片化 バッチエフェクト2. ライブラリ作製キットの違い バッチエフェクト3. 細胞培養のバッチ違い ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社ダナフォーム
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