遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

ssなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

バイオモダリティー登録システム『PatRegi|Bio』

多様なバイオモダリティー情報の登録・管理をHELMネイティブのソリュー…

【特長】 ■ウェブベースのアプリケーションで、オンプレミス又はクラウドに設置し共同研究をサポート可能 ■お客様個別のニーズに対応した、きめ細かなカスタマイズが可能 ■コーポレートのモノマーデータベースと連動した、直感的なバイオ分子エディタ「BioEddie」で複雑な分子も素早く、正確に描画 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LB...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメン...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

BaseSpace 『Correlation Engine』

トランスレーショナルサイエンスを支援する 全ての研究者のための強力な…

ライフサイエンス分野のBig Dataには文献、治験、化合物をはじめとする様々な公共データベースで公開されている情報が登録されています。これらの情報をもとに網羅的なマイニング検索を行うことはすべてのライフサイエンスの基礎研究にとって重要な作業です。BaseSpace Correlation...

メーカー・取り扱い企業： セレスバイオサイエンス株式会社

アノテーション付与サービス

核酸配列やアミノ酸配列にリッチな注釈を付与し、遺伝子の機能解釈を補助し…

e ・Description=Gene description ・Gos ・EC ・KEGG ・CAZy ・BiGG_Reaction ・PFAMs （３）Interproは、複数のdimanデータベースを統合したデータベースです。これに検索を行うことにより、１Queryに対して、複数データベース由来の複数のdomain情報が付与されます。 （４）RNA-seqのリードを利用して、Assemb...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社メイズ

バイオアプリ用API『Biomolecule Toolkit』

HELMでバイオ分子の完全なハンドリングを実現！明確な表現を可能にしま…

ペプチドといった複雑なバイオ分子の取扱いにおいて、化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しするHELMベースのウエブサービスベースのツールです。 的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能。 既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張したり、バイオ分子登録システムの基盤としてご利用になれ、お客様独自のワークフローやビジネスロジックに合わせて、バイオ分子の正...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

デュピルマブの潜在的な新規適応症の同定

GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現…

Nebion社のPhilip Zimmermann、Jana Sponarova、Frank Staubliは、同社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、IL-4Rαに対するモノクローナル抗体で阻害剤として働くデュピルマブの発現パターンを解析しました。 『GENEVESTI...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

生命科学情報 検索ガイドブック　～研究者おすすめのWebリンク集

「こんなサイトがあったのか！」驚きと未知の、かつ確かな生物関係リンクへ…

■体裁：A5判　140頁 ■定価：1,800円＋税 ■著者：『生物の科学　遺伝』編集部 ■発行：エヌ・ティー・エス ◆リンク集 【Special】COVID-19関連リンク 【データベース】 ゲノム／タンパク質／染色体／マウスゲノム／植物種子／古生物／3D／進化／古典文献／データベース支援 【生物】 分類／ほ乳類／鳥類／爬虫類/両生類／魚類／昆虫／植物／外来生物／絶滅危惧種...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社エヌ・ティー・エス

【新製品情報】MOE 2017.11 新機能紹介

分子系のより直感的な操作が可能に！主な新機能や機能強化をご紹介！

低分子の結合のねじれ角を回転させた際のエネルギープロファイルを 予測するTorsion Profileの機能が追加されます。 さらに、新しいデータコンテンツとして、TCR-MHC複合体データベースが 追加されます。 【掲載内容】 ■エピトープマッピング ■VRディスプレイ「zSpace」のサポート ■Torsion Profile ■DNA/RNA 関連機能の強化 ■T...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

科学データの検索と参照

全ての科学研究データベースを横断検索

■単一の横断検索 ドットマティクス、社内リポジトリ、サードパーティ、それぞれのデータベースから横断検索ができる。必要な研究データを1か所で管理、共有し、ビッグデータの管理を効率化。進捗状況や優先順位に関する質問にすばやく回答できる。 ■詳細なレポート機能 科学者はプロジェクト...

メーカー・取り扱い企業： ドットマティクス株式会社

パスウェイ解析ソフトウェア『Partek Pathway』

次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストに…

ていて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。 【対応する解析メニュー】 ■パスウェイエンリッチメント解析 ■パスウェイANOVA パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。 （注）Partek Inc.はKEGG ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

立体異性体、互変異性など、各種異性体構造の生成『Isomers』

互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成！ヴァーチャルスクリーニングへの…

パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

新素材を生み出す研究開発のためのマテリアルズ・インフォマティクス

Material Science Webinar Series Vol…

AI分野とは異なり、しばしばまばらで高次元の、偏った、ノイズの多いデータを扱うノウハウが必要になります。 BIOVIAはこの課題に対して、PC上で保存されて活用しづらい「非構造化データ」とデータベース上にある「構造化データ」をデジタル上で統合して処理するソリューションと高スループットのシミュレーション技術を組み合わせた、独自のソリューションについてご紹介します。 ...

メーカー・取り扱い企業： ダッソー・システムズ株式会社

『SimGlycan』 糖鎖＆糖ペプチド構造解析ソフトウェア

糖鎖および糖ペプチドの質量分析データを用いたグライコミクス向けツール

SおよびMSnデータを自動で読み取り糖鎖構造を予測します。さらに、LC-MS/MSデータを用いた糖ペプチド分析を包括的にサポートします。SimGlycanは実験で得られたMS/MSデータを独自のデータベースと照合し、最終的に候補構造のリストをランク付きで生成します。...

メーカー・取り扱い企業： セレスバイオサイエンス株式会社

ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すこ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

『GlycanExplorer』 糖鎖特性評価ソフトウェア

バイオ医薬品向けハイスループット糖鎖特性評価ソフトウェア

GlycanExplorerは、糖タンパク質バイオ医薬品の糖鎖の特性評価と定量化のためのワンストップソフトウェアソリューションです。プリロードされた高解像度の正確な糖鎖スペクトルデータベースを使用して、比類のない信頼性で可能性のある糖鎖構造を特定できます。インタラクティブなチャートとプロットを備えた広範囲で包括的なデータ構成により、糖鎖サンプルの詳細なプロファイリングが容易になり、...

メーカー・取り扱い企業： セレスバイオサイエンス株式会社

統合計算化学システムMOE：アドオンツール『MOE-QFSS』

化合物ライブラリーから高速検索可能！類似構造検索にも対応のMOEアドオ…

『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に 構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで 高速な分子構造検索が可能です。 高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を 強力に支援します。 【特長】 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

グメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

『リファレンスデータ作成サービス』

ゲノムアセンブル、Phasing、Scaffolding、遺伝子予測や…

ngしてGFFファイルを作成します。 ・予測遺伝子とAssembled-mRAN配列にアノテーションを付与し、その結果をGFFファイルに挿入します。 ・これらのデータを検索表示する遺伝子カタログデータベース「Ansrch」（Webシステム）を提供することもできます。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社メイズ

【製品紹介】遺伝子発現データベース　GENEVESTIGATOR

データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reducti…

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【新製品情報】MOE-QFSSバージョンアップ紹介

統合計算化学システムMOE-QFSSの新バージョンについてご紹介！

当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。 「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ 横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

BaseSpace 『Cohort Analyzer』

コホート・臨床ゲノム解析を支援する 臨床・創薬研究者のための最強ビッ…

スで運用する解析プラットフォームですので、どこでも簡単に各種利用することができます。さらに、企業や大規模な研究機関ではAPIを利用した自動解析や複数ユーザのインポートデータを共有化してパーソナルデータベースを作成することができるEnterprise ライセンスプラットフォームを利用することができます。さらに基礎的な解析を希望するユーザにはCorrelation Engineライセンスをご提供してお...

メーカー・取り扱い企業： セレスバイオサイエンス株式会社