疎水性 | イプロス医薬食品技術

PRコンピューターで抗体モデリング・抗体設計を行うための有用なアプリケーシ…

近年、抗体医薬品開発を効率化するためにインシリコによる合理的な設計が益々重要となっています。統合計算化学システム MOEは、低分子、ペプチド、抗体、核酸などの広範なスケールの分子の設計に活用でき、創薬モダリティー開発に対応した分子モデリングソフトウェアです。ホモロジーモデリング、タンパク質デザイン、バーチャルファージディスプレイ、エピトープマッピング、分子表面解析、物性推算、化学的修飾候補部位...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

lysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

高速ドッキングシミュレーションツール『FlexX』

ポケット中で化合物配座をフラグメント単位で再構築することでリガンドと受…

、疎水相互作用等に対応 ■毎分数分子のドッキングを行うことができる ■複数コアを指定した並列計算に対応 ■ファーマコフォアを用いてドッキングポーズを絞れる ■水素結合ドナー/アクセプター、疎水性、環構造等、様々なファーマコフォアに対応 ■受容体構造の前処理やファーマコフォア拘束等の準備は　別モジュールのSeeSARを用いて簡単にできる ■当製品によるドッキングシミュレーションの結...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

分子高速アラインメントツール『FlexS』

リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolv…

クリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。配置は、ファーマコフォアの投影点の一致（水素結合、イオン結合、疎水性相互作用）と vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。【特長】 ■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う ■分子のフレキシビリ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】SVL Exchange：SVLプログラムの紹介

自身で作成したアドオンプログラムも公開可能！無償で利用できるプログラム

、SVLの概要を簡単に説明したうえで、 SVL Exchangeで公開されている中からプログラムをいくつかかピックアップして紹介しています。リガンド結合部位の静電ポテンシャルマップや疎水性／親水性原子の存在確率などを基に自動的にファーマコフォアモデルを作成するアドオンプログラムである「AutoPH4」などについて掲載。公開されているプログラムについて、簡潔に説明され...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…

【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析（疎水性/電荷） ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

リガンド-受容体相互作用2次元図『PoseView』

操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ！

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成するためのツールです。相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応しま…

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス