株式会社メイズ
最終更新日:2024-04-08 19:41:23.0
アノテーション付与サービス
『微生物ゲノム株間比較サービス』
『微生物ゲノム株間比較サービス』は、PacBioにより得られたほぼ完全長のコンティグ配列を使用して比較を行うサービスです。
構造を外観してどの程度の違いがあるのかを確認し、
その上で違いのある領域(SNP、IN/DEL、Inversion、translocation)の遺伝子を提示し、
さらに、アミノ酸配列の違いなどを提示します。
遺伝子予測情報は、2種類の予測パイプラインの結果をマージしたものを納品します。
また、オプションで、機能アノテーションについても、3種類のデータを提供することができます。
【解析内容】
■ゲノム配列を読む
■近縁株間のゲノム比較
■発現変動遺伝子を見つける
詳しくはカタログをご覧頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。 (詳細を見る)
『リファレンスデータ作成サービス』
PacBioが出力するロングリード配列を利用して、Assembleパイプラインを実行することにより、染色体に近づくような高品質なContig配列が得られます。
さらに、Phasing(アレルごとのContigが分離されて出力される)やScaffoldingも実現できるようになっています。
・最新の技術を使用して、ゲノム配列のassemblyや遺伝子予測、機能注釈を含めたリファレンスデータの作成を行います。
・生物種により、必ずしも同じ手順で、期待通りの結果をなるとは限らず、データ解析の各段階で評価を行いながら手法を検討して進めます。
・出力結果を検索参照できるWebシステムも提供します。
(詳細を見る)
『次世代シーケンサ 受託解析サービス』研究支援サービス
当社は、シーケンシング、候補遺伝子の絞り込み、データ評価のプロセスを
カバーする『次世代型シーケンサ受託解析サービス』を行っています。
豊富な知見をもとに、研究テーマに合わせた解析方法の選定をはじめ、
解析後のデータ評価も含め、専門スタッフがサポート。一貫したサービスにより、
お客様の研究成果に繋がるソリューションを提供可能です。
【特長】
■次世代型シーケンサによる受託解析方法を検討・実施
■高品質なシーケンシングと高度なデータ解析。多用な解析オプションも用意
■研究目的に応じた遺伝子リストを提示し、研究進行をスムーズに
■BLAST検索やID検索ができるプログラムも提案可能
※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。 (詳細を見る)
アノテーション付与サービス
(1)NCBI-nrへのBLASTによるアノテーションの付与
(2)OrthologDBであるEggNOGによるアノテーション
(3)Interproによるアノテーション
(5)RNA-seq リード の利用
(詳細を見る)
取扱会社 アノテーション付与サービス
〇次世代シーケンサ受託解析 Whole genome sequence :Assemble,Gene prediction,Annotation) RNA-seq:Assembled-mRNA配列作成、発現解析 ○遺伝子カタログデータベース作成:[Ansech] Webアプリケーション ○遺伝子関連ソフトウエア受託開発 ○遺伝子関連パッケージソフトウエア開発・販売 BLASTworks:Local blast search アプリケーション Subioplatform:オミックス解析アプリケーション Keymol-net:プロテイン間ネットワーク検索アプリケーション ○遺伝子関連受託データ解析 ・近縁株間比較による表現型に関連する遺伝子の探索 ・リファレンスデータ(ゲノム配列、mRNA配列等のデータセット作成) ○ゲノム解析用コンピュータの販売 ○研究計画のコンサルテーション
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