DNAコード化ライブラリー(DEL)：創薬スクリーニングの新手法

PR研究の初期段階を加速！NGSで化合物スクリーニングができるDNAコード…

効率的な化合物スクリーニング手法として、 創薬の現場などで一般的な手法として確立されてきているDNAコード化ライブラリー（DEL）。 Sigma-Aldrichでは多くの研究者がDELの技術を広く利用できるようするために、 独自のダイナミックライブラリー技術を持つDyNAbind社の協力を得てDELを簡易キット化しました。 準備された実験プロトコルに従いスクリーニングを進めた後は、...

メーカー・取り扱い企業： メルク株式会社ライフサイエンス（シグマ アルドリッチ ジャパン合同会社）

『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

Patsnap Bio | 強力な配列検索で特許調査を革新

網羅性の高い配列検索で特許調査を革新

製薬、バイオテクノロジー、農業業界に特化したPatSnapのBioは、DNA、RNA、タンパク質配列の検索により、特許情報や豊富な非特許文献リソースを特定します。 Patsnapの特許検索・分析ツールAnalyticsと連携し、より詳細な特許の解析が可能です。 高度なデータ処理技術と独自の検索 AI アルゴリズムで生物配列のFTOを飛躍的に改善し検索漏れリスクを低減します。 【特長】 ■大規模な...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分け...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

統合プロテオミクス解析ソフトウェア『PEAKS』

ボトムアッププロテオミクス対応！de novoシーケンシング・データベ…

『PEAKS』は、タンデム質量分析装置から得られたMS/MSスペクトルのボトム アッププロテオミクス対応の、統合的なプロテオーム解析ソフトウェアです。 データベースサーチ機能では、既知タンパク質のデータベースと照らし合わせる ことによって、サンプル中に含まれるたんぱく質や、翻訳後修飾の解析を 行うことが可能。 de novoシーケンシングやデータ検索を行うPEAKS Studio...

メーカー・取り扱い企業： インフォコム株式会社

タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO2016.1』

タンパク質立体構造データ共有を支援！クオリティーサマリー表示なども可能…

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの 共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散するタンパク質 立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に 活用可能です。 2016年末にリリースされた『PSILO 2016.10』...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の特性を明らかにしました。また、PCSK9遺伝子と共発現する遺伝子を同定しています。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録され...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【資料】バイオ・抗体創薬のための統合シミュレーションソフトウェア

モノクローナル抗体、ワクチン抗原、酵素、ペプチドなど、多様なバイオロジ…

シュレーディンガーのバイオロジクス・抗体創薬ツールは、 バイオロジクスの多岐にわたる高度なシミュレーションにより、開発期間の短縮に貢献します。 一例として、下記のような機能がございます。 ■タンパク質立体構造モデリングを用いた実験値予測と解析 ■FEP計算を用いた高精度な予測技術 ※詳しくは、お気軽にお問い合わせ下さい。 ...BioLuminate 弊社のタンパク質構造モデ...

メーカー・取り扱い企業： シュレーディンガー株式会社

バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』

抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能！

『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

透過電子顕微鏡シミュレーションソフト　BioNet BesTEM

TEM/STEM像を忠実にシミュレート！タンパク質試料やウイルスにも対…

『 BioNet BesTEM（バイオネット ベステム）』は、 日本電子株式会社（JEOL）や、米FEI社をはじめとする 国内・海外製の6極子型収差補正電子顕微鏡もシミュレート可能な、 透過電子顕微鏡画像シミュレーションソフトです。 収差補正電子顕微鏡が持つ光学系の影響を考慮したビーム強度、 Ronchigram（ロンチグラム）が計算可能。 マテリアル系のシミュレーションだけで...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社バイオネット研究所

DNASTAR Lasergene

すべての生命科学者のためのソフトウェア

DNASTAR社 Lasergene は、最先端の研究を行う生命科学者のための革新的で使いやすいデスクトップソフトウェアです。分子生物学、ゲノミクス、構造生物学の研究に必要なすべてのツールを備えており、バーサタイルなフルパッケージまたは各分野に必要なツールをまとめたスイートパッケージとして利用できます。1984年以来ソフトウェア開発を続け、現在では全世界90か国以上にユーザーを持っています。Las...

メーカー・取り扱い企業： シップスバイオサイエンス株式会社

『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス