ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

生命科学情報 検索ガイドブック　～研究者おすすめのWebリンク集

「こんなサイトがあったのか！」驚きと未知の、かつ確かな生物関係リンクへ…

◇読み物でも情報誌でもない、今までに無かった生物情報検索ガイド集！ ◇求める情報により速くたどり着ける！QRコード216個掲載＆リンクをPCに飛ばして即検索可能！ ◇Special Web Site情報として「新型コロナウイルス（COVID-19）」...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社エヌ・ティー・エス

科学データの検索と参照

全ての科学研究データベースを横断検索

■単一の横断検索 ドットマティクス、社内リポジトリ、サードパーティ、それぞれのデータベースから横断検索ができる。必要な研究データを1か所で管理、共有し、ビッグデータの管理を効率化。進捗状況や優先順位に関する質問に...

メーカー・取り扱い企業： ドットマティクス株式会社

統合計算化学システムMOE：アドオンツール『MOE-QFSS』

化合物ライブラリーから高速検索可能！類似構造検索にも対応のMOEアドオ…

『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に 構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで 高速な分子構造検索が可能です。 高速な化合物検索を通して、分子設計やバー...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

バイオアプリ用API『Biomolecule Toolkit』

HELMでバイオ分子の完全なハンドリングを実現！明確な表現を可能にしま…

いった複雑なバイオ分子の取扱いにおいて、化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しするHELMベースのウエブサービスベースのツールです。 的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能。 既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張したり、バイオ分子登録システムの基盤としてご利用になれ、お客様独自のワークフローやビジネスロジックに合わせて、バイオ分子の正規化、登録...

メーカー・取り扱い企業： パトコア株式会社

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの C...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

デュピルマブの潜在的な新規適応症の同定

GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現…

『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

アノテーション付与サービス

核酸配列やアミノ酸配列にリッチな注釈を付与し、遺伝子の機能解釈を補助し…

it protein=definitionに意味がある記述があるTOPヒット （２）OrthologDBであるEggNOG（http://eggnog5.embl.de/#/app/home）への検索結果をタブ区切りテキストで提供します。 ・Preferred name=Gene name ・Description=Gene description ・Gos ・EC ・KEGG ・CAZy ・B...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社メイズ

FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

ォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

簡単導入！電子実験記録ノート『BIOVIA Notebook』

【使用開始にあたり特別な準備やトレーニングが不要！】シンプルな画面構成…

に操作可能 ■導入&スタートが簡単 ■使用開始するまでに特別な準備やトレーニングが不要 ■Word / Excel / PowerPointや、多数のWebブラウザー対応 ■電子実験ノート内の優れた検索システムでデータを無駄なく活用 ※詳しくはPDFダウンロードよりご確認ください。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ウェーブフロント 本社

『リファレンスデータ作成サービス』

ゲノムアセンブル、Phasing、Scaffolding、遺伝子予測や…

、機能注釈を含めたリファレンスデータの作成を行います。 ・生物種により、必ずしも同じ手順で、期待通りの結果をなるとは限らず、データ解析の各段階で評価を行いながら手法を検討して進めます。 ・出力結果を検索参照できるWebシステムも提供します。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社メイズ

遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

【特長】 ■膨大な遺伝子発現データ ■高速な検索エンジン ■使いやすいインターフェース ■マニュアルキュレーション ■高品質なデータ ■データの正規化 ■定期的なデータ更新 ■あらゆるマシンで使用可能 【主な対応プラットフォーム...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

新素材を生み出す研究開発のためのマテリアルズ・インフォマティクス

Material Science Webinar Series Vol…

て特性が計算される）を加速することは出来ますが、MIの目指す理想的なソリューションは "逆 "の方向（望ましい特性に対して材料を発見する）を実現することです。この理想的な形を実現するには、自動運転や検索エンジンなどの他のAI分野とは異なり、しばしばまばらで高次元の、偏った、ノイズの多いデータを扱うノウハウが必要になります。 BIOVIAはこの課題に対して、PC上で保存されて活用しづらい「非構...

メーカー・取り扱い企業： ダッソー・システムズ株式会社

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

DNA 配列のアセンブリ 『CodonCode Aligner』

DNA 配列のアセンブリとアラインメント

・テキストファイルからのシーケンスの読み込み ・End Clip 機能 (低品質のシーケンス末端を切り取る機能) ・コンティグのアセンブル ・ヘテロ接合型突然変異の検索 ・Phrap で作成されたアセンブリの読み込みと編集 ・サンプル名に基づくグループ単位のアセンブルや整列 ・ヘテロ接合性の挿入と欠失の分析 ・プロジェクトから直接 Phred および Ph...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ヒューリンクス