『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

結晶形態解析ソフト

結晶形態解析ソフト

結晶形状の予測、結晶表面の安定性の分析、独自の添加物の開発、溶媒と不純物の影響の制御等への応用が可能。...

メーカー・取り扱い企業： ダッソー・システムズ株式会社

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

モデリング/分子力学・動力学計算シミュレーション『Amber』

溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数！NMR構造…

『Amber』は、生体分子のために開発された、モデリング および分子力学と動力学計算シミュレーションのパッケージです。 モデリングでは、核酸やアミノ酸のデータを用い構造を構築したり、 溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数用意 されています。 実験データを用い、NMR構造の精細化を行うこともできます。 【特長】 ■溶媒水分子の配置や系の中和などを行...

メーカー・取り扱い企業： コンフレックス株式会社

分子構造モデリングソフト

分子構造モデリングソフト

ます。 BIOVIA Materials Studio QSAR では、Chi、Kappa、e-state keys などのトポロジカル記述子を含む FAST 記述子を使用できます。 また、溶媒表面上の電荷分布を検査する Jurs 記述子、３D 記述子を 電子的相互作用などに拡張する VAMP 記述子、QSAR の計算に高度な 遺伝的アルゴリズムを適用する GFA が実装されています。...

メーカー・取り扱い企業： ダッソー・システムズ株式会社

熱力学物性推算ソフトウェア『COSMOtherm』

Ver. C30では推算精度と計算速度が向上！純物質の引火点予測などが…

得られる分子の表面電荷情報と 分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出し、得られた 化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 オプションとして、種々の溶媒分子を含む4000種類以上の有機化合物の 電荷分布データを収めたデータベースCOSMObaseも用意されていますので、 量子化学計算の手間を省くことも可能です。 【特長（Ver. C30 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』

抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能！

ング ■抗原―抗体複合体モデリング ■抗体薬物複合体(ADC)や 糖鎖修飾の検討 ■複数の配列を入力とした連続計算 ■バックミューテーション解析 ■配列と構造に基づいたLiabilityの検出 ■溶媒和を考慮した相互作用エネルギー(GBVI)や 　重鎖-軽鎖間の相互作用エネルギーによるモデル評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

反応分子動力学計算ソフトウェア『ReaxFF 2018』

応力計算可能！燃焼反応やポリマーの架橋反応のMDを加速させるための手法…

【ReaxFFの主な機能】 ■反応力場による構造最適化と分子動力学計算 (アンサンブルはNVE, NVT, NPT に対応) ■3 次元バルクモデルの構築（Packmol を使用した溶媒分子のランダム配置に対応） ■シミュレーティッドアニーリングおよび異なる温度領域の設定 ■分子動力学計算で得られた座標履歴のアニメーション表示と各種物理量の時間発展のグラフ表示 ■PyMDとの...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析 ■母核置換とのフラグメントベースの分子設計 ■3D-RISM法による溶媒解析 ■タンパク質表面解析 ■SBDDのためのプロジェクトデータ構築...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【製品総合ガイド】材料研究開発を加速する高速分子シミュレーション

高速分子シミュレーションによる材料研究開発を支援！当社の製品概要をご紹…

当社のMaterials Science Suiteは、幅広い材料研究分野への対応が可能です。 ■密度汎関数理論(DFT)計算・周期系第一原理計算による物性予測 HOMO/LUMO/pKa/溶媒効果/IR/Raman/UV-vis/VCD/NMR/ 酸化・還元ポテンシャル/ 3重項励起状態エネルギー/TADF S1-Txギャップ/蛍光/りん光/振動計算/ 構造最適化/遷移状態計算/反応経路...

メーカー・取り扱い企業： シュレーディンガー株式会社

ドラッグデザインソフト『MolDesk Screening』

高速スクリーニング計算機能を持つドラッグデザインパッケージソフト

■化合物の編集 　・化合物の新規作成や、既存分子の編集 　・2D構造から3D構造への変換、水素原子付加、MOPAC7電荷生成など ■構造最適化、MD計算 　・分子の構造最適化、MD計算、水溶媒・中和イオンの付加など ■タンパク質-化合物ドッキング 　・タンパク質のポケット指定、ドッキング計算、溶液NMR実験シグナルによるドッキング構造の補正 ■タンパク質のリガンド結合ポケット探索 ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社バイオモデリングリサーチ

【資料】Quantum ESPRESSO Interface

単一のグラフィカルインターフェース上で行うことで、効率よく計算作業行え…

ションを結晶構造作成から実行、解析まで単一の グラフィカルインターフェース上で行うことで、効率よく計算作業が可能。 さらに有効遮蔽媒質法の計算により、電極表面反応を始めとする 様々な表面-溶媒系の電子状態計算ができます。 【掲載内容】 ■ナノテクノロジーと計算科学 ■Quantum ESPRESSOについて ■Quantum ESPRESSO Interfaceの主な機能 ...

メーカー・取り扱い企業： シュレーディンガー株式会社

【事例】MaterialsStudioの水溶媒中金ナノ粒子の凝集

『Materials Studio』での水溶媒中の金ナノ粒子の凝集…

『Materials Studio』を活用した【事例紹介】 ◇ナノサイズの金属粒子である金属ナノ粒子が、特異な性質のために注目を集めています その典型例が表面プラズモン共鳴です。ステンドグラス等の鮮やかな色調のもとになっています 一方、この特徴はナノサイズのみの特徴であるため、粒子の凝集を防ぐ必要があります Materials StudioのモジュールであるForcite Plus...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ウェーブフロント 本社

【事例】MaterialsStudioのクマリンの光学特性計算

『Materials Studio』でのクマリンの光学特性計算シュ…

ン分子は光学的に活性であることも知られています。 モジュールの1つ「DMOL3」を活用する事により このような場合に光学特性を知る役に立ちます。 本事例では、クマリン分子の光学特性を真空中と水溶媒中それぞれにおいてシュミレートしました。 また、溶媒の考慮はCOSMO溶媒モデルを用いています。 【特長】 ■「マテリアルズインフォマティクス」にも最適 ■材料開発を効率化するシュミレー...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ウェーブフロント 本社

ベンチトップ全自動バッファー交換濃縮装置『UNAGI』

最大8サンプル同時処理！煩雑だったバッファー交換・濃縮を全自動で手間要…

ンです。 最大8サンプル同時処理。ソフトウェアは操作がとても簡単で、作業中どこに いてもよく、実験室にずっと留まっている必要がなくなります。 【特長】 ■最大8サンプル同時処理 ■溶媒を効率よく除去しサンプルの吸着を防止、96％以上の回収率を実現 ■UF/DFバッファー交換のレシピが組み込まれている ■使いやすいソフトウェア ■最大8個の希薄サンプルを1回で48mLから8m...

メーカー・取り扱い企業： Unchained Labs株式会社

熱力学物性推算ソフト『COSMOtherm』※適用事例集進呈

化合物、混合溶液などの幅広い物性予測を実現。医薬品・製剤プロセス等の各…

容】 ■気液平衡推算 （蒸気圧推算、2成分系気液平衡、臨界点近傍の気液平衡推算） ■液液平衡推算 （2成分系・3成分系の液液平衡、3成分3相平衡推算） ■固液平衡推算 （相対溶解度による溶媒スクリーニング、2成分固液平衡推算） ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【事例】MaterialsStudioの電解液内の金属イオン凝集

『Materials Studio』での電解液内の金属イオンの凝集…

als Studio』はバッテリー特性計算ができます【事例紹介】 ◇電解液内の金属イオンの凝集事例紹介 ・LiPF6/PC系電解液の凝集を調査するため、RDFの計算を行った ・RDFから、溶媒和シェルの大きさを調べることが出来る ・また、このモデルを使用してのイオン拡散係数や電荷輸送特性も計算できます 【製品特長】 ■「マテリアルズインフォマティクス」にも最適 ■材料開発を効...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ウェーブフロント 本社