3次元NMRを用いた多糖の分析

PRピークが重複する複雑な有機化合物の構造解析が可能です。

NMRを用いた有機化合物の構造解析では、一般的に1次元NMR (1H-NMR・13C-NMR)のほかに1次元NMR のピーク同士の相関を確認できる2次元NMRを用いてピークを帰属することで化合物の構造を決定します。しかし、類似構造を多数含む糖類などの化合物では2次元NMRでもピークが重複するため解析が困難です。このような場合には3次元NMRが有効です。 本資料ではオリゴ糖をモデル化合物として、3...

メーカー・取り扱い企業： 一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

解説資料進呈：サイトメトリーによるハイスループットスクリーニング

PR次世代治療薬を開発しているラボ必見。増え続ける化合物やライブラリーをス…

次世代の治療を研究しているラボは、入手できる検体量が限られていたり、 専門知識の不足という課題がある中で、増え続ける化合物やライブラリーをスクリーニングしなければなりません。 幹細胞、細胞治療、各患者にあわせたマテリアルなど、 複雑な細胞モデルを使用することは高度な解析が必要とされます。 ハイスループットスクリーニング（HTS）サイトメトリーはこのニーズに応えています。 今回ご提...

メーカー・取り扱い企業： ザルトリウス・ジャパン株式会社

NGSデータ解析ソフトウェア『Partek Flow』

次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行！RNA-seq…

『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケン...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

RNA-seqデータ解析　ユーイング肉腫の解析事例

Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析を…

　Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS／マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■環状ペプ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOEsaicによるMMP解析とR-group解析

MOEsaicを用いて重要な置換基の検出、キー化合物の発見などが可能に…

『MOEsaic』は、Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group解析などの SAR解析、分子設計、文書作成が行える「MOE 2016.08」のウェブアプリケーションです。 当アプリケーションを用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのア...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【新製品情報】シングルセルレパトア解析

シングルセルレパトア解析の事例を紹介！様々なOSのマシンで「Flow」…

『Partek Flow』（以下、Flow）は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列データを読み込んで、 遺伝子の発現量やDNAの変異などを解析することができ、T細胞やB細胞に 発現しているT細胞受容体（T...

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【技術情報】データ解析ソフトウェア　Partek Flow

データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご…

『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析す...

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『MOE』ペプチド解析

ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします

「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予...

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『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 ...

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【GENEVESTIGATOR技術情報】解析事例

乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物の解析

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能...

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『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化すること...

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【技術情報】KNIMEによるドッキング計算解析事例

他の解析ツールとの連携が容易！分子モデリングや機械学習と組み合わせた解…

BioSolveIT社から、さまざまな創薬支援ツールを『KNIME』上で 利用するためのKNIME Interfaces（23種の解析ノードセット）の 新バージョンがリリースされました。 メディシナルケミスト向けのリード化合物最適化ツールであるSeeSAR等の BioSolveIT社のツールを使った解析が可能です。 ...

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『MOE-AutoGPA』による3D-QSAR解析

MOEにCoMFA法/CoMSIA法による3D-QSAR解析を追加。化…

『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学 システムです。 使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることの...

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【技術情報】DNA-Seqデータ解析(変異遺伝子の検出)

6種類のプログラムを搭載！解析の目的やサンプルの状態に応じてプログラム…

当資料では、シーケンサーデータ解析ソフトウェアPartek Flowを 用いたDNA-Seqデータ解析について紹介しています。 DNA-Seqについての概要から始まり、変異や融合遺伝子の検出の プログラムについてご説明。 ...

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卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

■Windows/Mac/Linuxに対応 ■計算化学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応 【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリ...

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遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 ...

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量子化学計算ソフトウェア『Molpro』

電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を搭載した量子化学計算ソフトウ…

高精度な励起状態計算 【プロパティ計算】 ■熱力学物性: エンタルピー､エントロピー､分配関数､モル比熱など ■lRスペクトル ■多重極子モーメント ■励起エネルギーと強度 ■NBO解析､NPA解析 【解析機能】 ■MCSCF波動関数を用いたnon-adiabatic coupling matrix elementsの算出 ■CASSCF波動関数を用いた原子価軌道解析 ...

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遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

大量の実験結果を統合して解析を効率化！強力で使いやすい解析ツール

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析を効...

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量子化学計算ソフトウェア『Gaussian 16』

スペクトル計算における新機能や、計算速度向上を図る機能を追加！

「Gaussian」は、世界的に広く利用され、分子設計・構造解析・化学反応解析 などで、多大な成果をもたらしている量子化学計算ソフトウェアです。 メジャーバージョンアップ版『Gaussian16』では、励起状態の取り扱いや スペクトル計算における新機能...

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【技術資料】MOE のHLA 解析アプリケーションの紹介

統合計算化学システム「HLA-Modeler」「HLABAP」の概要と…

知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はHLA に結合する任意のペプチドの結合強度を予測し、 親和性の高いペプチド配列を提案します。 当資料では、これらのツールの概要と特長および解析例について説明します。 【掲載内容】 ■HLA-Modeler の概要 ■HLA-Modeler の特長 ■HLABAP の概要 ■HLABAP の特長 ■まとめ ※詳しくはP...

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材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』

最適な材料設計をお手元に。

トフォームです。SciMAPSは量子化学計算からメソスケール計算まで、時間的にも空間的にも異なるさまざまなスケールの計算科学手法に対応しています。SciMAPSには、使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。SciMAPSが提供するプラットフォーム上では、高分子の物性の推算をはじめ、低分子...

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量子化学計算ソフトウェア『Gaussian』

量子化学計算のデファクトスタンダード

『Gaussian』は、多種多様な分子・化学反応を解析・設計するための量子化学計算ソフトウェアです。最も有名で利用者の多い量子化学系さんソフトウェアで、分子設計・構造解析・化学反応解析などで多大な成果をもたらしています。 2017年はじめに、Ga...

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MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

たStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ■水素原子付...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

ンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

デュピルマブの潜在的な新規適応症の同定

GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現…

Nebion社のPhilip Zimmermann、Jana Sponarova、Frank Staubliは、同社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、IL-4Rαに対するモノクローナル抗体で阻害剤として働くデュピルマブの発現パターンを解析しました。 『GENEVESTIGATOR』は公共...

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遺伝子発現データベース『2-Gene Plot』

選択した2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を確…

『2-Gene Plot』は、同一プラットフォーム内で横断的に遺伝子発現を解析できる 「GENEVESTIGATOR」の解析ツールの一つであるSimilarity Search Toolsに 新たに追加された解析ツールです。 選択した2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸...

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【新製品情報】ClaritySuiteリリース

安全性知識ベースプラットフォーム。医薬品の安全性情報を統合し、トランス…

。 ClaritySuiteは、医薬品のライフタイム全体に亘る安全性情報（安全性薬理試験、非臨床試験、臨床試験、市販後レポート）を統合して、安全性シグナル検出、トランスレーショナル・セーフティ解析、およびファーマコビジランス業務の支援します。 - リアルタイムなシグナル検出 - 医薬品クラス安全性 - ターゲットクラス安全性 - 安全性監視 【掲載内容】 ■Clarify...

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バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』

抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能！

リケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの標準アプリケーションと組み合わせて、生物学的製剤の開発における 問題や課題をク...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【新製品情報】Scilligence Focus の紹介

ウェブベースのデータ解析・可視化ツール！新製品Focusの機能を紹介し…

Scilligence 社製統合プラットフォームの新製品Focusは、化学や生物学の データセットで複雑な分析を行うためのウェブベースのデータ解析・可視化ツールです。 RegMolの登録データと外部ソースからインポートしたデータを統合的に扱えます。 SAR解析機能ではRグループ分解が簡単に行え、可視化ツールではさまざまなタイプの ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】SONNIA 製品紹介

化合物の物理化学的特性間などの実験値との関係を可視化して解析することが…

当資料では、ニューラルネットワーク手法に基づくデータ解析が可能な SONNIAについて掲載しています。 MN-AM社製「SONNIA」は、自己組織化ニューラルネットワーク手法に 基づいて低分子化合物のクラスター解析とQSA(P)R解析を行います...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【新製品情報】Partek Flow 11.0リリース

解析アプリケーションに合ったデータの取込みをナビゲートすることでデータ…

当資料では、「Partek Flow」の新バージョンでの主な新機能や 変更点についてご紹介しております。 「Flow」は、ウェブブラウザーを介して利用するNGSデータ解析 ソフトウェア。新バージョンではインターフェイスが改良され、 空間トランスクリプトーム解析機能が強化。 各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ...

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『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

とができます。 相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【製品情報】Partek Flow12.0リリース

アライメント済の配列から転写因子が結合するゲノム領域の検出および可視化…

当資料では、NGSデータ解析ソフトウェア『Partek Flow』の バージョンアップで追加された主な新機能や変更点について ご紹介しております。 2024年7月にリリースされたFlow 12.0では、複数の機能が追...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

「MOEの分子構造データベースと創薬への活用」の資料進呈

『MOEの分子構造データベースと創薬への活用』技術資料を配布中！

す。 アプリケーションの実行環境のみならず、分子構造データベース機能や 開発環境も統合されているのが大きな特長です。 アプリケーションとして、ドッキングシミュレーション、分子動力学計算、 SAR解析、ライブラリー解析、フラグメント創薬ファーマコフォア解析、 タンパク質モデリング、変異体解析等が搭載。 また、分子、文字列、数値を統合して管理できる分子構造データベース機能が搭載。 MOEの分子構...

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MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解…

やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリン...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

MOLSISニュースレター 第10号 2019.07

創薬支援ツール等の新製品情報をはじめ、技術情報などを多数掲載！

【その他の掲載内容】 ■技術情報 ・OFF-X：臨床研究における遡及的情報の重要性 ・Scilligence Inventory 製品紹介 ・解析事例：がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索 ・MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析 ・リード化合物最適化ツール SeeSAR 9.0 リリース ※詳しくはPDF資料をご覧いただく...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

対話型SBDDツール『SeeSAR 5.5』

リガンドの結合サイト予測機能で、結合親和性の評価まで一連の解析が可能に…

ます。 今回のバージョンアップでは、リガンドが結合する可能性のあるサイトの予測 が可能になったほか、リガンド構造とそのプロパティーを総合的に評価する ために、一覧表示が追加され、より迅速な解析が可能になりました。 【特長】 ■メディシナルケミストのために設計 ■シームレスな分子設計が可能 ■リガンドの結合サイト予測機能 ■受容体－リガンドの相互作用解析が可能 ■リガンドの...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

量子化学計算ソフトウェア『TURBOMOLE』

励起状態の構造･プロパティを高速に算出！高速な量子化学計算ソフトウェア

『TURBOMOLE』は、非経験的量子化学計算ソフトウェアです。分子の光学スペクトルなどのプロパティ計算や触媒反応の解析などに用いられ、多くの成果をもたらしています。 時間依存密度汎関数法(TD-DFT)を用いて励起エネルギーの算出および励起状態の構造最適化を行うことが可能です。また、円二色性スペクトル(ECD...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

統合計算化学システム『MOE』核酸モデリング

統合計算化学システム『MOE』の核酸モデリング機能

の重ね合わせも可能です。 また、構築した核酸の物性推算や、ドッキング計算による核酸-タンパク 質複合体の構造予測ができます。 核酸の配列・立体構造・相互作用・物性を相互に関連付けて 解析することで、核酸創薬の現場を強力に支援します。 【特長】 ■核酸の構築、伸長、修正のための専用パネルを搭載 ■核酸用パラメーターの改良 ■一本鎖および二本鎖の構築、伸長、編集 ■アンチ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

安全性評価プラットフォーム『ChemTunes＆ToxGPS』

医薬品、化粧品、食品業界の化合物の毒性額研究、安全性研究に利用できます

医薬品局（US FDA）で実績のあるリスク評価のアプローチ ■証拠の重み付け（WoE : Weight of Evidence）アウトカム ■関連性、信頼性、一貫性、再現性に優れたリードアクロス解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

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【書籍発刊】「MOE」を用いた創薬研究の効率化　※抜刷進呈中

in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例としてCCG社の…

効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！ 「PDFダ...

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【セミナー情報】材料設計支援統合システム『MedeA』

幅広い機能や最新の適用例を知るうえで有効なウェビナーについてご紹介

Eの基本理論とその適用例 ■空間・時間スケールの大きな現象を取り扱う技術として、古典力場計算 ■化学や触媒分野に焦点を当て、古典力場計算の技術 ■Liイオン電池電極材の相安定性や構造劣化現象の解析に焦点を当てた事例 ■第一原理計算プログラムVASPなどを利用して、解析、物性評価した例 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！

ーの研究をサポートします。 国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、 タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、 ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。 現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍 『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』 の抜刷資料を進呈中。 「お問い合わ...

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【セミナー情報】MOEフォーラム2017開催報告

MOEの最新技術の紹介と5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して…

itope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有用性検証」 ■「タン...

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