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NMRと分子動力学計算の低分子化合物-タンパク質間相互作用の解析
PRNMRとMD計算で低分子化合物とタンパク質の相互作用を評価できます。
生理活性化合物の中には、タンパク質を標的として作用する化合物が数多く存在します。そのため、低分子化合物とタンパク質間の相互作用について構造的な知見を得ることは薬剤の開発にとって非常に重要です。 本資料では、NMRと分子動力学計算を用いて溶液中におけるL-トリプトファンとウシ血清アルブミン(BSA)の相互作用を解析した事例を紹介します。...詳しくは資料をダウンロード、またはお問い合わせくださ...
メーカー・取り扱い企業: 一般財団法人材料科学技術振興財団 MST
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タンパク質汚れ可視化ライト【ワープサーチ】WARP Search
PR菌の増殖源がひと目でわかる医療照明のプロ発明!タンパク質汚れ可視化ライ…
医療現場のニーズに応えて、医療照明のプロが発明しました。 WARP Searchは、雑菌の増殖源になるタンパク質汚れを特殊な光で可視化します。 普段目に見えないタンパク質汚れが一目でわかるので汚れを見逃さず、洗浄後はキレイが一目瞭然です。 タンパク質汚れには、弊社製品のソウジスキー(アルカリ性)での洗浄が効果的です。 好適な衛生環境を作り上げるために是非ともお役立て下さい。 【デモ機の貸...
メーカー・取り扱い企業: 合同会社アドミライ
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タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO2016.1』
タンパク質立体構造データ共有を支援!クオリティーサマリー表示なども可能…
「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの 共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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多様な条件で検索可能!生体高分子やリガンド複合体構造情報のデータベース…
『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データ共有を支援します。 公共データやin-houseデータなどの分散...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…
「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』
創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム
モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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「PROTAC(タンパク質分解誘導薬)の設計支援」の資料進呈
In silico 手法を利用したPROTAC(タンパク質分解誘導薬)…
『PROTAC』は、細胞内のユビキチン-プロテアソーム系を利用して 標的タンパク質を分解誘導する有機分子です。 細胞内において標的タンパク質およびE3リガーゼと複合体(三元複合体)を 形成することで両者を物理的に近接させ、標的タンパク質のユビキチン化 を引き起こします。 ...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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コンピューターで抗体モデリング・抗体設計を行うための有用なアプリケーシ…
。 統合計算化学システム MOEは、低分子、ペプチド、抗体、核酸などの広範なスケールの分子の設計に活用でき、創薬モダリティー開発に対応した分子モデリングソフトウェアです。ホモロジーモデリング、タンパク質デザイン、バーチャルファージディスプレイ、エピトープマッピング、分子表面解析、物性推算、化学的修飾候補部位の検出など抗体設計に活用できるアプリケーションがMOEには統合されています。 Fv、F...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現!
『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能
MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…
に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化 カタログを刷新しました。 ※詳し...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ!
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 (水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用)を分かりやすく 2次元で表示す...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション
MOEを用いたStructure-Based Drug Design(SBDD)が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』
抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能!
『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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MOEの最新技術の紹介と5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して…
es and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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MDシミュレーションのインターフェースが一新!メニューバーもさまざまな…
の主な新機能や機能強化を ご紹介しています。 日本語をはじめとする多言語がサポートされるようになり、大規模計算のための フレームワークなどが新機能として追加。 また、ドッキング、タンパク質の物性推算、抗体モデリング、MOEsaicの機能も 強化され、プロジェクトデータベースも更新されました。 【掲載内容】 ■日本語などの多言語のサポート ■ONIOM法によるQM/MM...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス
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【技術情報】PROTAC Modeling Toolsの追加手法
複数の手法によりPROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを…
『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬の1つである PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera)の開発を支援するためのMOEの カスタムアプリケーションです。 複数の手法によりPRO...
メーカー・取り扱い企業: 株式会社モルシス