3d | イプロス医薬食品技術

MOEにCoMFA法/CoMSIA法による3D-QSAR解析を追加。化…

『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学システムです。使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることの...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

タンパク質立体構造情報データベースシステム『PSILO』

多様な条件で検索可能！生体高分子やリガンド複合体構造情報のデータベース…

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質－リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データ共有を支援します。公共データやin-houseデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易にアクセスすることができます。【特長】 ■高速なテキスト検索 ■タンパク質...

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『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を...

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タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO2016.1』

タンパク質立体構造データ共有を支援！クオリティーサマリー表示なども可能…

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に活用可能です。 2016年末にリリースされた『PSILO 2016.10』...

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MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と...

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MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ...

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対話型 SBDD ツール『SeeSAR』

メディシナルケミストのための受容体ポケット中でのリード最適化ツール

『SeeSAR』は、滑らかで美しい 3D モデルにより、リガンド-受容体間の相互作用を理解し、リガンドの物性値やADMEプロパティを評価しながら、対話的に新規リガンドを設計できるソフトウェアです。リガンド原子毎の結合自由エネルギー寄与を算出し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムに...

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【新製品情報】SBDD統合ツール『SeeSAR 13』リリース

SeeSAR 13にフラグメント創薬のため新機能を追加、計算アルゴリズ…

当資料では、「SeeSAR 13」で更新された機能とDrugathon 2023の開催報告を掲載しております。「SeeSAR」は、メディシナルケミストのためのStructure-Based Drug Design (SBDD)統合ツール。新製品の「SeeSAR 13」がリリースされ、新機能としてリガンドの構造展開を支援する「MedChemesis」が追加。そのほか、タンパク質表面描画...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【新製品情報】SeeSAR 11リリース

共有結合ドッキングのサポートなど多数の機能強化！新機能を中心にご紹介し…

『SeeSAR』は、メディシナルケミストのために開発された3Dリガンド設計ツールです。リガンド-受容体間の相互作用解析、分子編集、ドッキングシミュレーション、フラグメント創薬、リガンド結合部位解析などの様々なSBDD機能が統合されています。バージョン11では、共有結合ドッキングのサポート、リガンド結合部位探索の刷新、結合部位の3Dモデルの出力等、多数の機能強化がなされていま...

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【新製品情報】PSILO 2018新機能紹介

散在するタンパク質立体構造データを統合！PSILO 2018の新機能を…

当資料では、タンパク質立体構造データベースシステム PSILO 2018の新機能について掲載しています。「PSILO」は、生体高分子やタンパク質ーリガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの散在するタンパク質立体構造データを統合し、ウ...

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