pcr | イプロス医薬食品技術

PR研究の初期段階を加速！NGSで化合物スクリーニングができるDNAコード…

効率的な化合物スクリーニング手法として、創薬の現場などで一般的な手法として確立されてきているDNAコード化ライブラリー（DEL）。 Sigma-Aldrichでは多くの研究者がDELの技術を広く利用できるようするために、独自のダイナミックライブラリー技術を持つDyNAbind社の協力を得てDELを簡易キット化しました。準備された実験プロトコルに従いスクリーニングを進めた後は、...

メーカー・取り扱い企業：メルク株式会社ライフサイエンス（シグマアルドリッチジャパン合同会社）

薄型恒温プレート『LABOPAD Series』

PR当製品で快適な作業を！無菌操作やプロテオミクスの処理に好適

『LABOPAD Series』は、直感的に操作可能で、設置スペースを選ばないコンパクトサイズの薄型恒温プレートです。「LABOPAD-C2」は0～100℃、「LABOPAD-H2」は室温＋3℃～100℃までに設定できるドライバスインキュベーター。当製品は、厚さが薄いため、どこでも簡単に持ち運べます。また、「LABOPAD-C2」は冷却機能が付いていますので、これまでの...

メーカー・取り扱い企業：トスク株式会社(旧十慈フィールド)

DNAランダムインテグレーション解析

短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析

外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランス...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】細菌叢の解析　※解析事例集進呈中

通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事…

当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “細菌叢の解析”の例では、PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定し、通常10,000程度はデータが得られます。さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかったマイナーなグループのデータを得ることができます。【事例概要】 ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】生菌微生物群集構造解析

EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…

選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析(自社データ)をご紹介します。大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって熱処理したサンプルでは大腸...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。外来DNAの挿入位置の決定…

『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。【特長】 ■目的・ターゲットにあわ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】12Sアンプリコン解析

検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…

魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて解析した例をご紹介いたします。相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバン消毒液を1ml/L添加。常温で持ち帰り、ラボにてフィルトレーション、DNA抽出などを行い、得られたデータをMitoFishに供与してホモロジー検索を行いました。その結果、...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

次世代シーケンス解析『ターゲットアンプリコン解析』

オプションサービスを多数ご用意！「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」と…

『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによってリーズナブルにご利用できるサービスです。解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HCO2198）／MiFish（12S V5）など。解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを無償提供し、サンプルをお送りいただきます。その...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】野生生物の食性解析

COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※…

当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析。具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコードオブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析

外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であ…

京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことでホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストであるハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。ブ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック