シミュレーション | イプロス医薬食品技術

PRハイスループット処理とマルチプレックス解析を実現！超高速フローサイトメ…

当資料では、超高速のフローサイトメトリープラットフォームを最大限に活用するヒントとコツについて解説しております。細胞ベースの分析では、細胞単位ベースでの情報を提供する機器としてフローサイトメーターが依然として有力なツールです。しかし従来のフローサイトメーターは、ハイスループットなデータ獲得が要求される最新の創薬研究に適した設計ではなく、そのまま研究ワークフローに当てはめようとすると、ワーク...

メーカー・取り扱い企業：ザルトリウス・ジャパン株式会社

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリング ■ファーマコフォア解析 ■フラグメント構造に基...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

NA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ド...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

高速ドッキングシミュレーションツール『FlexX』

ポケット中で化合物配座をフラグメント単位で再構築することでリガンドと受…

セプター、疎水性、環構造等、様々なファーマコフォアに対応 ■受容体構造の前処理やファーマコフォア拘束等の準備は　別モジュールのSeeSARを用いて簡単にできる ■当製品によるドッキングシミュレーションの結果をSeeSARに読み込み、　結合自由エネルギー Hydeスコア2を用いてドッキングポーズのリスコアリングが可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』

最適な材料設計をお手元に。

SciMAPSの各機能は、さまざまなシミュレーションに対して分子モデルを構築する構造構築機能（Build）、計算プログラムとそれに対するインターフェースから構成されるプラグインとして提供されるシミュレーション機能（Simulate）、シミュレー...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『Direct Force Field』

力場パラメータの問題を解決！高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア

『Direct Force Field』は、”さまざまな分子シミュレーションソフトウェアに高精度な力場パラメータを提供すること”を目的に開発された製品です。独自の手法によりパラメータの代用の問題を解決し、分子系に最適な力場パラメータをアサインすることが可能です...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！

『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。国内外で多くの導入実績...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

対話型 SBDD ツール『SeeSAR』

メディシナルケミストのための受容体ポケット中でのリード最適化ツール

し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムにモニタリングできます。ドッキングシミュレーションによるリガンドの配置、フラグメント交換や付加によるリガンド候補の出力を組み合わせて、研究者にあらたなリガンド候補を提案をします。【特長】 ■高速な結合自由エネルギー推算 ■容易な操...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【新製品情報】MOE 2020.09 の新機能

MDシミュレーションのインターフェースが一新！メニューバーもさまざまな…

モデリング、MOEsaicの機能も強化され、プロジェクトデータベースも更新されました。【掲載内容】 ■日本語などの多言語のサポート ■ONIOM法によるQM/MM計算 ■MDシミュレーションインターフェースの　機能拡張と再生プレイヤーの追加 ■HPCフレームワークの強化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

理論計算でビッカース硬さを推算する方法/事例/ソフトウェア

機械物性をシミュレーションするためのソフトウェア / 第一原理計算 M…

【技術資料】材料設計支援統合システム『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術により機械物性を推算することができるソフトウェアです。当ソフトウェアで推算可能な物性にビッカース硬さが新たに加わりました。材料の組成（およびその結晶構造）の情報のみを元にしてビッカース硬さ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOE抗体設計アプリケーション

コンピューターで抗体モデリング・抗体設計を行うための有用なアプリケーシ…

　・エピトープマッピング ★Developability の評価　・化学的修飾部位の検出　・pHや構造変化を考慮した物性推算　・熱安定性、溶解性、粘度 ★その他　・溶媒解析　・分子シミュレーション、分子動力学計算...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

力場計算支援ソフトウエア『Direct Force Field』

材料科学、生命科学向け力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとに…

「力場パラメータが足りなくて計算できない」、「化学的に誤った構造を結果として与える」、これらは、分子シミュレーションソフトウェアに付属する力場パラメータを利用して計算を行うと、しばしば直面する問題です。 Direct Force Fieldは、開発元の提供する高精度な力場パラメータを登録した力場パラメータ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

創薬モダリティの多様性に対応したソフトウェア《動画＆資料提供》

創薬モダリティに興味のある方必見！ 3つのライフサイエンスソフトウェア…

Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。・MOE 低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム・Scilligence 多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム・OFF-X 規制機関、学術論文、...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解…

.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現し...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【セミナー情報】材料設計支援統合システム『MedeA』

幅広い機能や最新の適用例を知るうえで有効なウェビナーについてご紹介

『MedeA』は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境です。開発元であるMaterials Design社では、当製品を紹介するためのウェビナーを開催しており、幅広い機能や最新の適用...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム

リガンドの結合様式を予測！より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現！

の様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。【特長】 ■化合物...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【セミナー情報】MedeA ユーザー会・セミナー報告

MedeAユーザー会がフランスで開催されました！日本ではJFCCにて開…

「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境です。開発元であるMaterials Design社では、ユーザー会を例年開催しており昨年は9月にフランスで開催しました。 ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

材料設計支援統合システム MedeA VASP　適応事例集

【※事例集を進呈！】第一原理計算プログラムVASPを用いて、電子状態か…

『MedeA』は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境です。本適用事例集は、当製品の開発元であるMaterials Design社にて配布している適用例をまとめたものです。第一原理計算プ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【新製品情報】MOE 2019.01 リリース

プロジェクトデータベースも更新！操作面においてもより便利に使いやすく改…

『MOE 2019.01』は、さまざまな分子のモデリングとシミュレーションに対応する統合計算化学システム「MOE」の新バージョンです。当資料では、代表的な新機能や機能強化を紹介。リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算、pHや構造変化を考慮した...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOE-Extensions for KNIME

簡単かつ柔軟なワークフロー作成！KNIMEで動作するMOEインターフェ…

【MOEを用いたワークフロー例】 ■化合物処理 ■AutoQuaSAR ■ドッキングシミュレーション ■ファーマコフォア ■タンパク質デザイン ■抗体モデリング　など ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】材料設計支援システム『SciMAPS』

三つの構造構築機能を工夫して利用することで、複雑な系を構築する二つの例…

分子シミュレーションを成功裏に行うには研究対象となる分子系のモデル化の成否が重要です。当システムの構造構築機能は、高分子鎖、結晶構造、表面構造などを作成する「基本構造構築機能」、アモルファス構造や...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】KNIMEによるドッキング計算解析事例

他の解析ツールとの連携が容易！分子モデリングや機械学習と組み合わせた解…

ました。メディシナルケミスト向けのリード化合物最適化ツールであるSeeSAR等の BioSolveIT社のツールを使った解析が可能です。当資料ではKNIMEを使ったドッキングシミュレーションの解析例を紹介しています。【掲載内容】 ■BioSolveIT KNIME Interfacesで利用できる機能 ■KNIME Interfacesによるワークフロー例 ■ま...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】力場計算機能のご紹介

Direct Force Fieldの力場パラメーターアサインから分子…

Aeon Technology 社は高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア「Direct Force Field」を通じ、力場データベースから力場開発ツールまで力場計算に関するさまざまなツールを提供しています。当資料では、Direct...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】MedeA Deposition

固体表面への原子団の継続的な堆積を自動的に実行することができます

当資料では、『MedeA Deposition』の力場計算によるシミュレーションをご紹介します。『MedeA Deposition』は固体表面への原子・分子の堆積、吸着といった現象を力場計算によってシミュレートするためのツールです。工業的に重要なさ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

「MOEの分子構造データベースと創薬への活用」の資料進呈

『MOEの分子構造データベースと創薬への活用』技術資料を配布中！

統合した計算化学プラットフォームです。アプリケーションの実行環境のみならず、分子構造データベース機能や開発環境も統合されているのが大きな特長です。アプリケーションとして、ドッキングシミュレーション、分子動力学計算、 SAR解析、ライブラリー解析、フラグメント創薬ファーマコフォア解析、タンパク質モデリング、変異体解析等が搭載。また、分子、文字列、数値を統合して管理できる分子構造データ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

材料設計支援統合システム『MedeA-HT』

MIのためのハイスループット計算ツール！材料設計支援統合システムをご紹…

『MedeA-HT』は、信頼性の高い計算データの大量生成・解析のためのツールとして開発された材料設計支援統合システムです。また、当システムは、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境「MedeA」に搭載されており、マテリアルズインフォマティクスに不可欠なシミュレーションによる大量データ生成を簡便に行うことが出来ま...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】MedeAによる第一原理計算とVASP 6.1

自動でパラメーターを調整！核となる第一原理計算プログラムは「VASP」…

『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術を基に、物性評価を行うための統合支援環境です。最新版では、VASPのバージョン6.1が組み込まれており、精度向上とともに高速化が図られています。当資料では、Mede...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【新製品情報】SeeSAR 11リリース

共有結合ドッキングのサポートなど多数の機能強化！新機能を中心にご紹介し…

『SeeSAR』は、メディシナルケミストのために開発された3Dリガンド設計ツールです。リガンド-受容体間の相互作用解析、分子編集、ドッキングシミュレーション、フラグメント創薬、リガンド結合部位解析などの様々なSBDD機能が統合されています。バージョン11では、共有結合ドッキングのサポート、リガンド結合部位探索の刷新、結合部位の3D...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】材料設計支援統合システム『MedeA-HT』の適用

MedeA-HTを用いたSlater-Pauling 曲線の作成例をご…

MedeAは原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境です。第一原理計算が比較的容易に行える現在において、データ生成を目的とし異なるモデル構造に対して、同じ計算を繰り返し実行する場面...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス