タンパク質 | イプロス医薬食品技術

PRNMRとMD計算で低分子化合物とタンパク質の相互作用を評価できます。

生理活性化合物の中には、タンパク質を標的として作用する化合物が数多く存在します。そのため、低分子化合物とタンパク質間の相互作用について構造的な知見を得ることは薬剤の開発にとって非常に重要です。本資料では、NMRと分子動力学計算を用いて溶液中におけるL-トリプトファンとウシ血清アルブミン（BSA）の相互作用を解析した事例を紹介します。...詳しくは資料をダウンロード、またはお問い合わせくださ...

メーカー・取り扱い企業：一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

タンパク質汚れ可視化ライト【ワープサーチ】WARP Search

PR菌の増殖源がひと目でわかる医療照明のプロ発明！タンパク質汚れ可視化ライ…

医療現場のニーズに応えて、医療照明のプロが発明しました。 WARP Searchは、雑菌の増殖源になるタンパク質汚れを特殊な光で可視化します。普段目に見えないタンパク質汚れが一目でわかるので汚れを見逃さず、洗浄後はキレイが一目瞭然です。タンパク質汚れには、弊社製品のソウジスキー（アルカリ性）での洗浄が効果的です。好適な衛生環境を作り上げるために是非ともお役立て下さい。【デモ機の貸...

メーカー・取り扱い企業：合同会社アドミライ

タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO2016.1』

タンパク質立体構造データ共有を支援！クオリティーサマリー表示なども可能…

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム

リガンドの結合様式を予測！より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現！

『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。化合...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

に利用できます。【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化カタログを刷新しました。 ※詳し...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。以下のような解析が...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』

抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能！

『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEのカスタムアプリケーションです。抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと...

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【セミナー情報】MOEフォーラム2017開催報告

MOEの最新技術の紹介と5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して…

es and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有...

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【新製品情報】MOE 2020.09 の新機能

MDシミュレーションのインターフェースが一新！メニューバーもさまざまな…

の主な新機能や機能強化をご紹介しています。日本語をはじめとする多言語がサポートされるようになり、大規模計算のためのフレームワークなどが新機能として追加。また、ドッキング、タンパク質の物性推算、抗体モデリング、MOEsaicの機能も強化され、プロジェクトデータベースも更新されました。【掲載内容】 ■日本語などの多言語のサポート ■ONIOM法によるQM/MM...

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【新製品情報】SBDD統合ツール『SeeSAR 13』リリース

SeeSAR 13にフラグメント創薬のため新機能を追加、計算アルゴリズ…

sed Drug Design (SBDD)統合ツール。新製品の「SeeSAR 13」がリリースされ、新機能としてリガンドの構造展開を支援する「MedChemesis」が追加。そのほか、タンパク質表面描画機能の強化などの情報を多数ご紹介しております。是非、ご一読ください。【掲載内容(一部)】 ■SeeSAR 13の概要 ■新機能：MedChemesis ■タンパク質表面描画機能の強...

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【新製品情報】PSILO 2022.02の新機能

創薬研究を支援！PSILO 2022.02で追加される新機能をご紹介

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。公共データやインハウスデータを統合的に管理し、独自の検索機能や解析機能により創薬研究を支援します。 PSILO 2022...

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「MOEの分子構造データベースと創薬への活用」の資料進呈

『MOEの分子構造データベースと創薬への活用』技術資料を配布中！

能や開発環境も統合されているのが大きな特長です。アプリケーションとして、ドッキングシミュレーション、分子動力学計算、 SAR解析、ライブラリー解析、フラグメント創薬ファーマコフォア解析、 タンパク質モデリング、変異体解析等が搭載。また、分子、文字列、数値を統合して管理できる分子構造データベース機能が搭載。 MOEの分子構造データベースの特長と、アプリケーション事例が紹介された記事「M...

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GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

プロプロテイン変換酵素サブチリジン／ケキシン9型(PCSK9)は血漿中のコレステロールの恒常性の調節に対して極めて重要な酵素です。それは低比重リポタンパク質(LDL)受容体パスウェイおよび肝臓でのLDLの分解の天然阻害剤として働きます。 GENEVESTIGATORを使った詳細な解析によりPCSK9の発現は栄養状態およびスタチン治療により直接...

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分子情報およびアッセイデータ登録システム『RegMol』

RegMolでは低分子から高分子まで様々な種類の分子の情報を登録可能！

子まで様々な種類の分子の情報を登録できます。例えば、RegMolにペプチドを登録する場合、プロジェクトや構造式、CAS 番号などの外部ID、名前、純度やLogPなどの物性情報、治療領域や標的タンパク質、電子実験ノートのページ番号、( 購入試薬の場合は) メーカー名やカタログ番号および購入日、NMRやHPLCなどのスペクトル、添付ファイルなどを登録します。また、RegMolに既に登録された分子...

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統合計算化学システム『MOE』核酸モデリング

統合計算化学システム『MOE』の核酸モデリング機能

【その他の特長】 ■相互作用解析 ■核酸-タンパク質ドッキング ■物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

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創薬モダリティの多様性に対応したソフトウェア《動画＆資料提供》

創薬モダリティに興味のある方必見！ 3つのライフサイエンスソフトウェア…

「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。・MOE 低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム・Scilligence 多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム ...

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【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品のモデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの配座解析、物性予測、相互作用解析な...

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【書籍発刊】ELNによる研究データの統合的管理　※抜刷進呈中

クラウド型電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや活用例として、…

ついて】前半ではクラウド型電子実験ノート（ELN）の概要と利点の一般的な説明を行います。後半ではクラウド型ELN製品『CDD Vault ELN』の特長を解説するとともに、低分子化合物の研究、タンパク質分解誘導薬の研究、製薬企業とCROとの間の情報共有、国際的な共同研究プロジェクトでの情報共有などの活用事例を紹介します。...

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ターゲット・作用機序予測プラットフォーム『CLARITY』

化合物の有効性と安全性のプロファイルを解明！より包括的な予測が可能に！

作用機序の活性、毒性や安全性およびADMEパラメーター全般、代謝物とその薬理学的影響といった広範なプロファイリングを予測します。化合物ライブラリーのバーチャルスクリーニング、標的タンパク質決定後の解析、ドラッグ・リポジショニング、潜在的な毒性や安全性の問題の予測、オフ・ターゲットの相互作用の判別、代謝物に関連する安全性問題の把握などに活用できます。【特長】 ...

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インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！

ションと豊富なデータコンテンツで、計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、 タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍『in silico創薬におけるスクリー...

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『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

ができます。分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド...

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MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解…

MOEノード)が提供されます。ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデー...

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【新製品情報】MOE 2022.02の新機能

効率良く計算可能！MOE 2022.02の主な新機能や機能強化をご紹介

MOE 2022.02では、高性能なM1チップ搭載Macがサポートされることに加え、 タンパク質モデリング関連のアプリケーションでGPUを使用した計算ができるようになり、これまで以上に効率良く計算できるようになりました。さらに、Hydrogen Mass Repartition...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】創薬モダリティの多様性への対応

ELN、RegMol、Inventoryに共通する創薬研究のモダリティ…

トフォームを提供しています。電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。当資料では、ELN、RegMol、Inventoryに共通する創薬研究におけるモダリ...

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【セミナー情報】MOEフォーラム2020 開催報告

統合計算化学システム！5名の先生方にMOEを活用した研究事例についてご…

名の先生方に MOEを活用した研究事例についてご講演いただきました。また、開発元のCCG社からは、対話的なSAR解析が行える MOEウェブアプリケーションのMOEsaicの機能強化、タンパク質の開発可能性や化学修飾部位予測にかかわる物性推算機能の応用事例、次バージョンのMOEやPSILOの機能について発表しました。ぜひ、ご一読ください。【掲載内容】 ■招待講...

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【新製品情報】PSILO 2018新機能紹介

散在するタンパク質立体構造データを統合！PSILO 2018の新機能を…

当資料では、タンパク質立体構造データベースシステム PSILO 2018の新機能について掲載しています。「PSILO」は、生体高分子やタンパク質ーリガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。 ...

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リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応しま…

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示す...

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【新製品情報】SeeSAR 8.0リリース

FBLDのためのInspirator機能の強化！配列表示機能を改良した…

性、リガンド物性などを評価できます。今回のリリースでは、バージョンアップによるFragment Based Ligand DesignのためのInspirator機能の強化およびタンパク質の構造アラインメントの機能の強化と、配列表示機能の改良を行いました。【掲載内容】 ■FBLDのためのInspirator機能の強化 ■タンパク質構造のアラインメント機能の強化 ...

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【技術資料】PROTAC Modeling Tools

三元複合体のモデリング手法の概要とその適用事例についてご紹介します

『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬 PROTACの開発を支援するためのMOEのカスタムアプリケーションです。 4通りの手法によりPROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行え、タンパク質...

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『MOE 2016.08』新機能のご案内

タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載

「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加されました。Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【新製品情報】SeeSAR 10 リリース

概要をはじめ、分子表面のクリッピング機能などを掲載！創薬支援ツールのご…

lveIT社から、SBDD統合ツールの新版『SeeSAR 10』がリリースされました。従来の操作性はそのままで、より直感的に使用できるようにGUIを再設計。その他の新機能として、タンパク質の構造改変を行うProtein Editor モード、結合部位の形状や深さの視覚化を支援する分子表面のクリッピング機能、 SMARTS表現を用いたファーマコフォア拘束、フラグメント伸長のた...

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【新製品情報】SeeSAR 7.1リリース

ユーザーインターフェース刷新！使いやすさがより向上した創薬支援ツールを…

ユーザーインターフェースが刷新されました。ヘルプマニュアルが充実し、使いやすさがより向上しました。【掲載内容】 ■ヘルプマニュアルの充実、ユーザーインターフェースの刷新 ■複数のタンパク質構造の取り扱い ■ファーマコフォアの設定 ■原子間結合の回転と二面角のラベル ■その他の機能増強 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

Scilligence version 6.3.1　新機能紹介

電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など研究情報を一元管理…

プラットフォームを提供。電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。【掲載内容】 ■Scilligence 統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】CITE-seqデータ解析『Partek Flow』

幅広くご利用可能！Flowを用いたCITE-seqデータ解析について紹…

き、複雑なコマンド入力が不要なので、データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用いただけます。【掲載概要】 ■CITE-seq とは ■細胞表面タンパク質の解析 ■ハッシュタグ・デマルチプレキシング ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス