NMRと分子動力学計算の低分子化合物-タンパク質間相互作用の解析

PRNMRとMD計算で低分子化合物とタンパク質の相互作用を評価できます。

生理活性化合物の中には、タンパク質を標的として作用する化合物が数多く存在します。そのため、低分子化合物とタンパク質間の相互作用について構造的な知見を得ることは薬剤の開発にとって非常に重要です。 本資料では、NMRと分子動力学計算を用いて溶液中におけるL-トリプトファンとウシ血清アルブミン（BSA）の相互作用を解析した事例を紹介します。...詳しくは資料をダウンロード、またはお問い合わせくださ...

メーカー・取り扱い企業： 一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

【研究施設】低風量型ドラフトチャンバー　MDA

PR最大級の内部有効空間をもつ化学用フードのフラグシップモデル

＜確固たる低風量化を支える深化した機構＞ 低風量型ドラフトチャンバー先進国のヨーロッパで約35,000台の実績のあるワルドナー社のサポート技術に、ダルトン独自の技術を融合させたグローバルスタンダードです。 ＜様々なシーンで万一に備える安全性の追求＞ ドラフトチャンバーに対する長年培ったノウハウとプライドをもってダルトン独自の厳しい基準で、ディテールまで配慮された基本性能です。 ＜行...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ダルトン

インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！

リング、立体構造に基づく分子設計、 ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。 現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍 『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』 の抜刷資料を進呈中。 「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出し...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CDD Vault：ADC、PROTACのデータ管理

ADCやPROTACの研究データも管理可能！導入実績多数のクラウド型研…

米国CDD社により開発・運用されている『CDD Vault』は、化合物・抗体・細胞などのサンプル情報とアッセイ情報の管理・共有機能、電子実験ノート機能、および可視化機能を有するクラウドサービスです。 創薬研究データの管理システムにおける導入や管理に要する手間を省き、システムをすぐに利用できます。 当資料では、CDD VaultのADC（antibody-drug conjugate：抗...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【CBIS技術情報】製剤研究における情報管理

多様なデータを統合管理！製剤研究における情報管理についてご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 製剤研究においては、主剤や添加剤の配合成分に関連する情報をはじめ、 成分の混合比率、使用する機器情報、混合時の温度や時間といった処理条件、 製剤後の物性について、測定値、測...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】医薬品の探索と薬理・安全性予測

独自の予測モデルにより薬理活性、毒性・安全性、代謝産物の予測を行います…

『Chemotargets CLARITY』は、膨大な量のアッセイデータと有害事象レポートを 整理統合して活用することで、隠れた知識を発見し、医薬品開発の効率を 改善する革新的なデータサイエンス・ソリューションです。 アッセイデータは、公共および商用データベースから取得した524万以上の 化合物に対する448万以上の相互作用情報から成り、有害事象情報は、過去50年間 にFAERSから...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】Single Cell RNA-seqデータ解析

Single Cell RNA-seqのデータ解析を行う為の豊富な機能…

『Partek Flow（以下Flow）』は次世代シーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 リード配列からバーコードやUMIのトリミング、参照ゲノム配列への アラインメント、UMIのデデュプリケーション、バーコードの絞り込みなど、 Single Cell RNA-seqの前処理に必要な機能を搭載しています。 当資料ではFlowを用いたSingle Cell RNA-seqデータ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】データ解析ソフトウェア　Partek Flow

データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご…

『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq、ChIP-seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOEsaicによるMMP解析とR-group解析

MOEsaicを用いて重要な置換基の検出、キー化合物の発見などが可能に…

『MOEsaic』は、Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group解析などの SAR解析、分子設計、文書作成が行える「MOE 2016.08」のウェブアプリケーションです。 当アプリケーションを用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 指定した部分構造だけが異なる分子ペ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CBIS：バイオ系創薬研究データの管理

研究に関わる多様なデータを統合管理！CBISのバイオ系創薬研究向けのモ…

ChemInnovation Software社製『Chemical and Biological Information System』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、参考文献やレポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンスで高いご評価をいただいて...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】共有結合ドッキング KNIME ワークフロー

データパイプラインを視覚的に作成するためのモジュール式のワークフローツ…

「KNIME」はデータ分析やレポート作成を行うためのオープンソースの統合 プラットフォームです。 BioSolveIT 社は、KNIMEのパートナーであり、創薬支援ツールをKNIME上で 実行するためのノード群を無償で提供しています。 当資料では、SeeSAR 11で追加された共有結合ドッキングの機能を用いた KNIME ワークフローを紹介します。 【掲載内容】 ■KNI...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】ハイブリッド汎関数による高精度なバンド構造評価

固体エネルギーバンド構造の詳細を計算するための事例について掲載！

当資料では、III-V族化合物半導体で電子・光学デバイスのバンド構造 エンジニアリングに必要となる、固体エネルギーバンド構造の詳細を 計算するため、Hartree-Fock-DFTハイブリッド汎関数であるHSE06を用いた 事例について報告します。 InAsのエネルギーバンド、特にその微細構造を例として、精度の高い 第一原理電子状態計算を用いることで、実験に匹敵する精度と信頼性を持つ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】MOE-FTrees インターフェイス

開発言語SVLを用いて当社が開発！解析例や実行環境などを掲載しています

当資料では、独BioSolveIT社が開発した「FTrees」を、統合計算化学システム「MOE」から実行させるためのインターフェイスを紹介します。 本インターフェイスはMOEの開発言語SVLを用いて当社が開発したもので、通常コマンドラインで実行する化合物ライブラリーあるいは巨大なケミカルスペースからの類似構造検索を、MOEウィンドウ上で実行可能。 「MOE」と「FTrees」を使用されているユ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】遷移金属酸化物表面の反応性評価

MedeA-VASPによる遷移金属酸化物表面の反応性評価について掲載！

当資料では、MedeA環境に統合された第一原理計算ソフトウェア 「MedeA-VASP」を用いた遷移金属酸化物表面のモデリング事例について 掲載しています。 酸化触媒としても使用される酸化鉄（ヘマタイトFe2O3）の(0001)面 についてさまざまな表面終端モデルの表面エネルギーを評価し、 触媒として活性な表面構造について解析します。 【掲載内容】 ■表面エネルギーによる酸化...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】Batchremovalツールによるバッチ効果の低減

バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能についてご紹…

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、 RNA-seqやSingle Cell RNA-seq等のデータを解析することが可能。 当資料では、バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Flowの製品概要 ■Batch re...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CBIS: 汎用的な電子実験ノート

データ散逸の防止や検索による閲覧性向上で、研究を効率化！　CBISの汎…

当資料では、研究情報共有システムCBISの汎用電子実験ノート機能についてご紹介いたします。 電子実験ノートのメリットやCBISと汎用電子実験ノートの機能について詳しくご説明。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 【掲載内容】 ■電子実験ノートのメリット ■CBISの概要 ■CBISの汎用電子実...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【CBIS技術資料】研究情報の共有

多様なデータを統合管理！CBISを活用した研究情報の共有についてご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 当製品は複数ユーザーが同時に使用することができ、研究情報の共有に メリットを発揮します。ログインするだけで、閲覧・情報登録・編集が可能。 台帳の編集待ちなどが発生せず、作業...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【書籍発刊】ELNによる研究データの統合的管理　※抜刷進呈中

クラウド型電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや活用例として、…

株式会社技術情報協会から2023年12月27日に『実験の自動化・自律化によるR&Dの効率化と運用方法 －AI、ロボット技術、ChatGPT、MI、ベイズ最適化、秘密計算など－』が発刊されました。 本書では、ラ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CDD Vaultの製品概要

共同研究の情報共有プラットフォームとしても多数の実績あり！ 研究情報管…

米国Collaborative Drug Discovery社により開発・運用されている『CDD Vault』は、化合物・抗体・細胞などのサンプル情報とアッセイ情報の管理・共有機能、電子実験ノート機能、および可視化機能を有するクラウドサービスです。 創薬研究データの管理システムにおける導入や管理に要する手間を省き、すぐに利用できるため、製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】SVL Exchange：SVLプログラムの紹介

自身で作成したアドオンプログラムも公開可能！無償で利用できるプログラム

当資料では、SVLの概要を簡単に説明したうえで、 SVL Exchangeで公開されている中からプログラムを いくつかかピックアップして紹介しています。 リガンド結合部位の静電ポテンシャルマップや疎水性／親水性原子の 存在確率などを基に自動的にファーマコフォアモデルを作成する アドオンプログラムである「AutoPH4」などについて掲載。 公開されているプログラムについて、簡潔に...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CLARITYによる化合物プロファイル

プロファイルを予測するための計算プラットフォームを提供！予測手法などを…

当資料では、Chemotargets CLARITYにおける化合物のプロファイル 予測手法について掲載しています。 「Chemotargets CLARITY」は、医薬品候補化合物の薬理学的に重要な 側面であるターゲット、安全性、代謝物について適切にプロファイルを 予測するための計算プラットフォームを提供します。 T-link、S-link、M-linkという3種類のリンク情報が...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】統合計算化学システム『MOE』

「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4…

「Reverse Fingerprint Modeling」は、MOEユーザーコミュニティーのための SVLコード交換サイトSVL Exchangeで公開されている統合計算化学システム MOEのアドオンプログラムです。 化合物のさまざまな分子フィンガープリントと活性値の情報を用いて、 活性化合物に共通の部分構造や活性/不活性に寄与する部分構造を特定したり、 ファーマコフォアモデルを構...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】CDD Visualization

共同研究の情報共有プラットフォームとしても実績あり！フリーの解析・可視…

米国Collaborative Drug Discovery社（CDD社）により開発・運用されている「CDD Vault」は、化合物・抗体・細胞などのサンプル情報とアッセイ情報の管理・共有機能、電子実験ノート機能、および可視化機能を有するクラウドサービスです。 創薬研究データの管理システムにおける導入や管理に要する手間を省き、システムをすぐに利用可能。製薬企業やベンチャー企業、CRO、大学や...

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【技術情報】膨大なケミカルスペースに対する超高速類似構造探索

創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール！原理と適用事例につ…

薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactama...

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【技術情報】MOE: CLEの紹介

様々な特性に基づいて試薬と生成物を対話的にフィルタリング！新規アプリケ…

MOE 2022.02には新規アプリケーションとして「Combinatorial Library Enumeration（以下、CLE）」が追加されました。 CLEは、化学反応に基づいてコンビナトリアルライブラリーを生成するとともに化合物の合成に必要な反応試薬の検索を行うことのできるウェブアプリケーションです。 分子記述子や化学基、保護基などの様々な特性に基づいて試薬と生成物を対話的にフィ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】FastGrow機能搭載、ケミカルスペース拡充

各ソフトウェアのアップデートと、Drugathon2022の開催報告を…

独BioSolveIT社はSBDD統合ツールSeeSARとケミカルスペース高速探索ツール infiniSeeを提供しています。SeeSAR 12.1では、FastGrow機能が搭載され、 フラグメントデータベースの拡充がなされました。 また、これらのソフトウェアを活用して特定の標的タンパク質に対する新規 リガンド設計を競うBioSolveIT Drugathon 2022がオンライン開...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術情報】PROTAC Modeling Toolsの追加手法

複数の手法によりPROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを…

『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬の1つである PROTAC（Proteolysis Targeting Chimera）の開発を支援するためのMOEの カスタムアプリケーションです。 複数の手法によりPROTACを介した三元複合体（標的タンパク質-PROTAC-E3 リガーゼ）構造の予測とモデリングを容易に行えます。最近、三元複合体構造を モ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【GENEVESTIGATOR技術情報】解析事例

乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物の解析

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 「乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物」の解析では、 隣接正常組織と比較して乳がん組織で発現が有意...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術資料】MOE のHLA 解析アプリケーションの紹介

統合計算化学システム「HLA-Modeler」「HLABAP」の概要と…

ヒト白血球型抗原（HLA）の立体構造は細胞性免疫の分子機構を解明する ために重要な分子です。 当社では、MOE上で動作するHLAに特化したホモロジーモデリングツール 「HLA-Modeler」とHLA 結合抗原性ペプチド予測ツール「HLABAP」を 開発しました。 「HLA-Modeler」は、構造未知のHLA の立体構造を既知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はH...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

【技術資料】創薬モダリティの多様性への対応

ELN、RegMol、Inventoryに共通する創薬研究のモダリティ…

Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や 在庫管理など研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合 プラットフォームを提供しています。 電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、 在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス