植物種をDNA鑑定により同定 当社では、未知の植物サンプルがどの種に属するのかを、DNA鑑定により 同定するサービスをご提供しております。 植物種の同定によく使われる遺伝子領域をPCRで増幅し、塩基配列解析を実施。 得られた配列を公的データベースと照合して結果を報告いたします。 また、遺伝子領域としては原則として「ITS1」を用いております。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【検査方法】 1.植物種の同定によく使われる遺伝子領域をPCRで増幅 2.塩基配列解析 3.得られた配列を公的データベースと照合 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行！RNA-seqをはじめ様々なアプリケーションのデータ解析に対応！ 『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq） ■メタゲノム解析 【対応機器】 ■イルミナ（HiSeq, NextSeq, MiSeq, MiniSeq） ■サーモフィッシャー（Ion S5, Ion Proton, Ion PGM） 『Partek Flow』は、ウェブブラウザーから操作するのでコマンド入力したりパラメーターを手入力する必要はありません。インストールしたサーバーに接続可能なネットワーク上のあらゆるマシンから利用できます。読み込んだデータの種類に対応した解析メニューを表示しますので、データ解析に慣れていないウェットの研究者でも簡単に操作できます。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストにKEGGパスウェイ情報を使って生物学的解釈を追加 『Partek Pathway』は、Partek Genomics Suiteで次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを解析して得られた遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているパスウェイを抽出できます。どのようなパスウェイが遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているかを知ることで実験結果に生物学的解釈を得ることができます。 また、『Partek Pathway』は遺伝子の発現情報から全体が協調して発現変動しているパスウェイや一部の遺伝子だけが発現変動していて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。 【対応する解析メニュー】 ■パスウェイエンリッチメント解析 ■パスウェイANOVA パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。 （注）Partek Inc.はKEGG Authorized Service Providerです。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

キャピラリーシーケンスや微生物同定など、当社のDNAシーケンス解析サービスをご紹介 北海道システム・サイエンス株式会社では、『受託DNAシーケンス解析サービス』 をご提供しております。 送付いただいたDNAサンプルのシーケンス解析を行う「キャピラリーシーケンス サービス」をはじめ、「Primer Walkingサービス」 「微生物同定サービス」「SNP解析サービス」をご用意。 また、オプションサービスもございます。 ご用命の際は、当社へお気軽にご相談ください。 【サービス内容（抜粋）】 ＜キャピラリーシーケンスサービス＞ ■送付いただいたDNAサンプルのシーケンス解析を行う ■サイクルシーケンス反応を1回行い、得られたデータを送付 ＜Primer Walkingサービス＞ ■プライマーウォーキング法による長鎖塩基配列を決定 ■解読した塩基配列からプライマー設計・合成、シーケンス解析を行う ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

畑土壌の健康状態をチェック 当社では、畑土壌の健康状態をチェックする方法として注目されている 「PCR-DGGE法」によるDNA検査を行うサービスを提供しております。 土壌中の微生物のDNAをまとめて抽出し、PCR-DGGE法で解析し、 「生物多様性指数」を算出。 生物多様性指数の変化を見ることで、土壌の健康状態を評価できるため、 農薬使用の削減につながります。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【検査方法（PCR-DGGE法）】 1.土壌サンプルからDNAを抽出する 2.細菌相用または糸状菌相用のプライマーを用いてPCRを行う 3.PCR産物をDGGE法で解析し、画像データを取得する ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。